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圆斑星鲽Ⅰα基因的克隆与组织表达分析

时间:2022-11-17 百科知识 版权反馈
【摘要】:同源分析表明,圆斑星鲽MHCⅠα氨基酸序列与其他硬骨鱼具有31%~74%的同源性,与人的相似性较低。利用荧光定量PCR分析组织表达发现MHCⅠα基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有表达,但表达量存在差异,肾的表达量最高,肌肉和皮的表达量最低。本研究通过大规模EST测序,结合RACE技术获得了圆斑星鲽MHCⅠα的全长cDNA序列,并分析了MHCⅠα的组织特异性表达,为进一步研究MHC基因的多态性与鱼体抗病力的关系奠定了基础。

圆斑星鲽MHCⅠα基因的克隆与组织表达分析

圆斑星鲽MHCⅠα基因的克隆与组织表达分析(1)

王 娟1,2 李宏俊2 刘 星1 苏 浩2 高祥刚2 赫崇波2 王宏伟3

(1.辽宁师范大学生命科学学院,辽宁大连,116029;

2.辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁大连,116023)

摘 要 采用表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,成功获得了圆斑星鲽MHCⅠα的全长cDNA序列。该cDNA全长2 171bp,5′UTR为20bp,3′UTR为1 053bp,开放阅读框(ORF)长度为1 098bp,可编码365个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(α1、α2),IGC类似区(α3),连接肽(跨膜区)和胞质区5个结构域。同源分析表明,圆斑星鲽MHCⅠα氨基酸序列与其他硬骨鱼具有31%~74%的同源性,与人的相似性较低。利用荧光定量PCR分析组织表达发现MHCⅠα基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有表达,但表达量存在差异,肾的表达量最高,肌肉和皮的表达量最低。

关键词 圆斑星鲽;MHCⅠα;基因克隆与表达

主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物体内与机体免疫功能密切相关的一个基因家族,也是基因组中多态性最丰富的区域,不同个体间MHC多样性水平的不同可以导致个体对疾病的抗性和易感性的差异[1-3],因此MHC作为抗病的候选标记受到动物遗传育种学家的高度关注。根据化学结构和功能的不同,MHC分子可分为MHCⅠ类分子和MHCⅡ类分子,在哺乳动物中还存在MHCⅢ类分子[4]。MHCⅠ分子是由α和β链非共价键结合组成的异二聚体,存在于所有有核细胞表面,主要与内源性抗原相结合,其中α链包括α1、α2和α3以及跨膜区和胞内区[5],多态位点集中分布于α1、α2形成的抗原结合域[6]。

圆斑星鲽(Verasper variegatus),俗称花斑宝、花瓶片,自然分布于我国黄渤海和东海、日本北海道以南至九州沿海。其肉质鲜美,营养丰富,经济价值高[7],深受广大消费者与养殖户的欢迎。近些年,国内学者先后对圆斑星鲽的生物学[1]、繁殖生物学[9-11]和分子生物学[12-15]等方面进行了研究,并取得重要进展,但圆斑星鲽抗病机制的研究尚未见报道。本研究通过大规模EST测序,结合RACE技术获得了圆斑星鲽MHCⅠα的全长cDNA序列,并分析了MHCⅠα的组织特异性表达,为进一步研究MHC基因的多态性与鱼体抗病力的关系奠定了基础。

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