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中国对虾基因的组织表达分析

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:利用RT-PCR分析中国对虾FcMKK4基因在不同组织中的表达水平,结果表明,FcMKK4基因在肌肉、肝胰腺、淋巴、心脏、胃、鳃、肠、血细胞中均有表达。图37为氨氮胁迫后,中国对虾FcMKK4基因在各组织中的相对表达量变化。在各时间点,氨氮胁迫组FcMKK4基因的相对表达量均高于对照组。本研究从中国对虾EST文库中查找比对获得中国对虾MKK4基因一段序列,克隆获得其全长,并命名为FcMKK4。

利用RT-PCR分析中国对虾FcMKK4基因在不同组织中的表达水平,结果表明,FcMKK4基因在肌肉、肝胰腺、淋巴、心脏、胃、鳃、肠、血细胞中均有表达。在肌肉中的表达量最高(为血细胞中表达量的13.47倍),其次为肝胰腺 . 心脏 . 鳃 . 胃 . 淋巴 . 肠(分别为血细胞中表达量的7.19倍、6.60倍、6.46倍、6.44倍、5.34倍和4.23倍),在血细胞中的表达量最少。

图37 中国对虾FcMKK4基因在不同组织中的表达分布

1:肠;2:鳃;3:胃;4:心脏;5:淋巴;6:肝胰腺;7:肌肉;8:血细胞。

图37为氨氮胁迫后,中国对虾FcMKK4基因在各组织中的相对表达量变化。结果显示,与对照组相比,FcMKK4基因相对表达量在鳃、胃、心脏、肝胰腺、肌肉和血细胞中首先表现为下调趋势,其中在鳃、胃、肝胰腺、肌肉和血细胞中的相对表达量在3 h最低,分别为对照组的0.58倍(P , 0.01)、0.79倍(P , 0.05)、0.18倍(P , 0.01)、0.60(P , 0.01)倍和0.53倍(P , 0.01);在心脏中的相对表达量在6 h最低,为对照组的0.87倍(P . 0.05)。随后,FcMKK4基因的相对表达量出现上调,并分别在72、72、6、48、72 和48 h达到最大值,相对表达量分别为对照组的3.94倍(P , 0.01)、3.44倍(P , 0.01)、1.72倍(P , 0.01)、1.84倍(P , 0.01)、1.36倍(P , 0.01)和2.35倍(P , 0.01),且FcMKK4的相对表达量总体呈现先下降后上升再下降的变化趋势。

与上述情况相反,氨氮胁迫后,中国对虾FcMKK4基因在肠中的相对表达量呈现先上调后下调再上调的变化趋势,且分别在24 h和96 h达到最大值,相对表达量分别为对照组的2.17倍(P , 0.01)和2.97倍(P , 0.01)。在各时间点,氨氮胁迫组FcMKK4基因的相对表达量均高于对照组。

MKK4基因自从非洲爪蟾中首次被克隆以来,其分子功能及机制等得到较为深入的研究,但主要结果大多来自人和小鼠等生物,且与生长及免疫过程密切相关。在甲壳动物中仅见水蚤(Daphnia pulex)(Colboume et al,2011)和斑节对虾(孙文文等,2012)有报道。本研究从中国对虾EST文库中查找比对获得中国对虾MKK4基因一段序列,克隆获得其全长,并命名为FcMKK4。该基因全长2.0.4 bp,其开放阅读框1.2.1 bp,编码一个由406个氨基酸组成的多肽。三级结构预测显示,软件只能预测同源性部分(氨基酸残基范围98~391)的模型,因此估计,前段几十个氨基酸残基很可能是loop区,对整体构型影响不大,和油菜(Brassica campestris L.)BnMKK4预测结果相似(张国腾等,2012)。信号肽预测结果显示,FcMKK4不含信号肽,与油菜BnMKK4结果不同[31],表明MKK4基因在植物和动物中表达存在明显差异。保守结构域分析表明,FcMKK4基因预测蛋白存在S-TKc保守结构域,且该蛋白属于PKc超家族,PKc-MKK4亚族。经BLASTP比对,FcMKK4基因编码的蛋白质属于MKK4家族,且与其他无脊椎动物的MKK4具有高度同源性(68%~80%)。系统进化分析表明,中国对虾FcMKK4与无脊椎动物聚为一支。MKK4是一个高度保守的基因,已在多种动植物中分离出MKK4基因的同源序列。同源序列分析表明,FcMKK4基因编码的氨基酸序列与其他物种一样高度保守,且GYDVRSDVWSLGTTL基序在无脊椎和脊椎动物中均高度保守。综上所述,可以确定该序列为中国对虾MKK4基因序列。

图38 氨氮胁迫后中国对虾FcMKK4基因在不同时间的表达变化

a:肠; b:鳃; c:胃; d:心脏; e:肝胰腺; f:肌肉; g:血细胞

对MKK4 在不同物种各组织中的表达情况的研究表明,在成年小鼠(Musmusculus)和人类的各组织中MKK4mRNA均广泛表达,且在骨骼肌和大脑中的表达量较高。在斑节对虾各组织中也均有表达(孙文文等,2012),且存在明显的组织差异性。与斑节对虾相比,MKK4在中国对虾各组织中均有表达,但表达趋势有所不同。中国对虾FcMKK4基因在肌肉中的表达量最高,其次为肝胰腺、心脏、鳃、胃、淋巴、肠,在血细胞中的表达量最少。而斑节对虾MKK4基因组织相对表达量由高到低依次为肠、鳃、淋巴、肝胰腺、心脏和血细胞,这可能与选取的实验对虾处于不同的生长发育阶段有关,因为MKK4在生物生理过程中起着重要作用,不同的生长发育阶段可能有着不同的组织分布。

由于MKK4基因在生物生理及病理过程中起着重要作用,近年来已在多个物种中进行了研究。对小鼠及人的研究主要集中于MKK4基因在细胞凋亡、炎症反应和肿瘤发生中的重要作用,在植物中则有MKK4基因参与非生物胁迫及病害相关的信号传导的报道。Kong等(2011)的研究表明,玉米(Zeamays)中ZmMKK4的转录水平受到冷胁迫、盐胁迫和外源H2O2胁迫的影响而出现上调,在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,ZmMKK4基因的过表达则可增加对冷胁迫和盐胁迫的抗性。Jonak等(1996)研究发现,冷刺激能够激活紫花苜蓿(Medicagosativa L.)中的p44MKK4基因的表达和活性。张国腾等(2012)的研究则表明,油菜(B.campestris L.)中BnMKK4基因的表达受低温胁迫和盐胁迫的诱导。为探索中国对虾FcMKK4基因在非生物胁迫应答中的作用,本研究采用64mg/L的NH4Cl海水溶液对中国对虾进行氨氮胁迫实验,结果表明,中国对虾鳃、胃、心脏、肝胰腺、肌肉、血细胞和肠中FcMKK4的表达量均有明显的胁迫时间差异。氨氮胁迫后,在鳃、胃、心脏、肝胰腺、肌肉和血细胞中的表达量先下调后上调,在肠中表达量则先上调后下调,且在各组织中各时间点FcMKK4的表达量变化不尽相同,其原因可能是组织器官功能差异性所致(2012)。中国对虾FcMKK4基因在组织中的表达量无论是先下调后上调(如鳃、胃等),还是先上调后下调(如肠),其总体趋势呈现出上调和下调波动性反复变化的趋势,由此可推测,中国对虾FcMKK4基因在抵抗持续性氨氮胁迫中起着重要作用。关于MKK4在虾类中的作用机制方面的研究尚未见报道,而虾类MKK4是否具有与其他动物MKK4相似的功能,还有待进一步的研究。

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