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三疣梭子蟹核受体基因的克隆及在蜕皮中的功能分析

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:我们从实验室构建的三疣梭子蟹转录组文库中获得一个HR38的EST序列,对该基因进行全长克隆、生物信息学分析以及在蜕皮周期表达分析,初步探讨其与蜕皮激素之间的联系。因此推测,在三疣梭子蟹肝胰腺中,PTHR38基因的表达受营养状况与蜕皮激素水平双因素影响。

核受体是一类在生物体内广泛分布的配体依赖性转录因子,核受体与相应的配体及其辅调节因子相互作用,调控基因的表达(M R et al,2003)。蜕皮激素与核受体家族中的蜕皮激素受体(EcR)以及超气门蛋白(USP)形成异二聚体启动蜕皮级联反应,作为一条典型的蜕皮激素通路在昆虫中具有广泛的研究。HR38作为孤儿受体家族的成员,是除蜕皮激素受体(EcR)之外,唯一一个能与过剩气门蛋白(USP)形成异二聚体的核受体。在果蝇(Drosophila)的研究中发现并证明了HR38调节了另外一条非典型的蜕皮激素信号通路(Baker K D et al,2003)。除此之外,也有研究证明HR38在调控蜕皮激素早期应答基因、碳水化合物的代谢、表皮的形成等方面具有重要的作用(Sutherland J D et al,1995;Hilliker A et al,2007;Ruaud A et al,2011)。尽管HR38在昆虫中具有比较深入的研究,但是水生甲壳类中关于HR38的报道却十分罕见。我们从实验室构建的三疣梭子蟹转录组文库中获得一个HR38的EST序列,对该基因进行全长克隆、生物信息学分析以及在蜕皮周期表达分析,初步探讨其与蜕皮激素之间的联系。

三疣梭子蟹HR38基因(PTHR38,GenBank登录号:KP954701)全长2.9.0 bp,包括2.2.8 bp的开放阅读框(ORF),101 bp的59端的非编码区(UTR)和551 bp的39UTR(图26)。该基因编码一个由765个氨基酸组成的蛋白质,预测相对分子质量为84.2 3103,理论等电点为6.3。采用Interpro Scan在线软件分析,PTHR38属于孤儿受体家族,具有核受体锌指结构、DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD),没有跨膜结构域。采用ProtParam tool软件分析,该基因负电荷的氨基酸残基总数(Asp1 Glu)为74,正电荷的氨基酸残基总数(Arg1 Lys)为65,不稳定系数计算值为64.49,亲水性平均数为20.473,是一类不稳定的蛋白。

图26 三疣梭子蟹HR38基因cDNA全长及其编码的氨基酸序列

ATG:起始密码子;*:终止密码子;方框:DNA结合区;下划线:配体结合区。

图27 HR38氨基酸序列比对

利用NCBI BLAST对三疣梭子蟹HR38基因编码的氨基酸序列进行比对,发现该序列与大型蚤(Daphniamagna)的HR38相似性最高,为70.6%。与其他物种如印度跳蚁(Harpegnathossaltator)、黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)、赤拟谷盗(Tribolium castaneum)、佛罗里达弓背蚁(Camponotus floridanus)、剑水蚤(tigriopus japonicus)和意蜂(Apismellifera)的HR38的相似性分别为67.3%、 60.4%、55.3%、52.7%、50.5%、48.0%和45.7%(图27)。利用MEGA6.0软件进行系统进化分析表明,切叶蚁、印度跳蚁和意蜂HR38亲缘关系较近,三疣梭子蟹PTHR38与昆虫HR38亲缘关系较近,与蚤类亲缘关系较远(图28)。

对三疣梭子蟹HR38在蜕皮周期的各个组织中进行实时定量分析(图29),结果表明:该基因在蜕皮周期的各个组织中均出现不同程度的差异表达现象,说明PTHR38参与到三疣梭子蟹的蜕皮调控过程中。这与Kozlova等关于HR38在整个发育时期都表达这一结论相一致(Kozlova T et al,1998)。血淋巴中该基因的表达量在蜕皮前期高于蜕皮间期和蜕皮后期,这个表达模式与血液中20E的浓度变化相一致,推测PTHR38在三疣梭子蟹中也与蜕皮激素具有一定的相互作用。眼柄中HR38在蜕皮后期明显降低,也说明了PTHR38与蜕皮激素具有相互的联系,但是具体的作用关系还有待于进一步的探讨。有研究表明,HR38参与到碳水化合物的代谢和糖原的合成(Af R et al,2011)。肌肉和肝胰腺中,该基因在蜕皮后期表达量高于蜕皮前期和蜕皮间期,推测该基因在三疣梭子蟹中可能参与能量物质的代谢。

图28 MEGA 6.0软件采用邻接法构建的三疣梭子蟹与其他物种的HR38氨基酸的系统进化树

注:分叉处数值表示1 000次重复抽样所得到的置信度,只显示置信度 . 80%的数值;标尺长度代表每个位点发生0.1次置换。

图29 三疣梭子蟹HR38基因在不同蜕皮时期各个组织中的表达分布情况

注:同一组织内,不同字母之间为差异显著(P , 0.05),相同字母之间为差异不显著(P . 0.05),下同。

图30 去除单侧眼柄后PTHR38基因在三疣梭子蟹蜕皮前期与正常对照各个组织中的相对表达情况

图31 去除单侧眼柄后PTHR38基因在三疣梭子蟹蜕皮间期与正常对照各个组织中的相对表达情况

图32 去除单侧眼柄后PTHR38基因在三疣梭子蟹蜕皮后期与正常对照各个组织中的相对表达情况

甲壳类的神经内分泌调节中心:X器-窦腺复合(XO-SG)体着生于眼柄基部。XO-SG合成和分泌蜕皮抑制激素(MIH),MIH作用于Y器官从而抑制蜕皮激素的合成(Chung J S et al,2003;Hopkins P M et al,1992)。去除单侧眼柄,可以减小MIH对Y器的抑制作用,使体内蜕皮激素水平增高(Kj L et al,1998;Zarubin T P et al,2009)。对去除单侧眼柄后,PTHR38在各个组织的表达情况进行定量分析(图30、图31、图32),结果表明:去除单侧眼柄相对于正常对照,PTHR38基因的表达量在整体上呈不同程度的上升趋势,推测三疣梭子蟹HR38基因的表达量与蜕皮激素水平呈协同作用。但是在各个时期的肝胰腺中,去除单侧眼柄造成了PTHR38表达量的降低。由于HR38参与碳水化合物的代谢和糖原的储存,并且蜕皮伴随着能量消耗的过程。因此推测,在三疣梭子蟹肝胰腺中,PTHR38基因的表达受营养状况与蜕皮激素水平双因素影响。

(作者:张龙涛,吕建建,高保全,刘萍)

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