要选择品位最高、最具特色与优势的内容为研究重点。就《伤寒论》而言，郭老以为下述项目可列为重点研究内容。
1. 方证的规范研究。包括《伤寒》与《金匮》方证的脉证与应用指标的规范，目的是将后世医家与近、现代的新经验概括进去。此项研究应当组织全国各地的临床家，尤其是对仲景方证拥有丰富实践经验的临床家来承担。
伤寒方证的确定性是很高的，只在方能对证，确有桴鼓相应之效。事事讲究实用的日本人，甚至以“方证相对”为临床上分析病情、采取措施的理论指导，他们对方证的研究也很有成效。其中包括证本质的研究，方原理研究等。对方证的研究，着眼于“机能状态”的探索，着眼于“调节机制”的探讨，有可能引出新理论，以丰富仲景学说的内容。此外，对剂型改革的研究也很重要，目前中药汤剂浪费很大，又不方便服用，日本汉方药的剂型可以借鉴。还须指出，日本人着重方证的应用与研究，忽视六经病及其传变转归规律的应用与研究，其思路的局限性，导致临床范围及疗效水平的局限性，我们的研究工作应吸取其教训。
2. 重点方证原理及系列方药研究。此项研究以仲景原理为指导，临床与实验紧密结合，充分利用现代研究方法与手段进行，目的在于阐明原理，改革剂型，提高疗效。系列方药，不拘六经，总以病情演变的实际需要为准。系列方药的命名有两种形式：一是方证，如柴胡汤证系列，桂枝汤证系列，青龙汤证系列，五苓散证系列，四逆汤证系列，等等；二是病机，如表证系列方，饮证系列方，水证系列方，血证系列方，气证系列方，等等。方与药都可以根据后世伤寒家的经验，予以增损。
3. 六经病的本质及其传变规律。以临床观察为主，在大量观察获得广泛共识的基础上，结合实验研究，以揭示其本质或规律。
（1）提纲证的研究：提纲证反映多种疾病过程的共性，必然存在共同的病理变化和共同的物质基础。通过此项研究可能揭示六经病的本质。重点是太阳，少阳，太阴，少阴提纲证。
（2）六经病的本质研究：六经病是《伤寒论》最大最难也最有意义的问题，古今医学解释六经病的本质的学说不下数十种，大多属于推理性，缺乏实践研究依据。六经病提纲证，反映了许多疾病在其各自的病程中某一特定阶段的共性，实际上表明人体某些器官组织的功能和物质发生了共同的障碍。伤寒学家抓住这一共性进行调治，使许多疾病得到缓解，有的则因此而治愈。例如，感冒、肺结核、胸膜炎、急慢性胆囊炎、各型肝炎、急慢性肾盂肾炎、流行性腮腺炎、支气管炎、疟疾、不明原因发热、梅尼埃综合征、心肌炎等数十种疾病，从西方医学看来，缺乏共同的病理基础，甚至风马牛不相及，但在其病程中都可以出现少阳病，而用小柴胡汤或略事加减使其缓解。被西方医学所忽视了的这种联系到多个脏器组织的功能与物质发生障碍的共性病理变化，恰恰是仲景学说的特点与优势。通过此项研究，可能揭示人体生理、病理某些内在联系的新规律，更有针对性的采取措施，提高疗效。
（3）六经病的传变、转归规律。六经病既然是人体某些器官组织的功能与物质发生共同障碍的结果，必然有特定的传变、转归规律，仲景在《伤寒论》中所描述的规律，是从普遍的意义上讲的，对现代医学诊断的各种疾病，就不是千篇一律了，而是各有各的规律，有的可有初则太阳病，继则少阳病或阳明病，不一定随经入腑，出现蓄水证、蓄血证或腑实证；有的则由经传腑，出现蓄水、蓄血、甚至直传少阴。如此等等，说明只有一个病一个病地进行实践研究，摸清规律，以提高疗效。关于这点，大连市运用六经辨证理论治疗流行性出血热的全过程的观察总结，提供了很好的思路与样板。
传变转归的研究要以临床观察为主。因其多样性和复杂性，必须采取一个病一个病的整个过程的观察，与多种疾病过程的观察相结合的方式进行，才能摸清规律。项项研究以外感发热性疾病为主，其中以病毒感染性疾病为首选，预计易见成效。通过此项研究，可能发现一些新规律，也可为系列方药的制备，提供实践基础。
（4）寒温结合研究。以临床实践研究为主注意观察寒温结合点及其证治，如少阳半表半里证与三焦湿热证的结合，阳明腑实证与心包痰热证的结合，少阴热化证与营热瘀滞证的结合等，都是较为常见的。有的是在疾病的同一阶段，寒温合邪；有的则是在疾病的一同阶段，或寒或温，故需一个病一个病的全过程观察。此项研究包括外感、内伤诸病。
通过以上研究成果的日积月累，可能建立起六经辨证新体系。这个新体系既是仲景学说的延伸与发展，又具有显著的时代特征。
（5）造就新一代的伤寒家，继续发展伤寒学派。举目综观，当今中医界能应用一些仲景方治疗疾病者为数不少，而真正掌握六经辨证，运用六经传变理论指导疾病的全过程的治疗者，则为数不多了，应当引起注意。培养新一代的伤寒家，最好是通过研究生途径，划出一定的床位，进行全过程的观察治疗，着重临床实践能力的培养，而不应当培养成伤寒文献研究生。或许有人会问，现在人们多主张“寒温统一”，有必要发展伤寒学派吗？其实“寒温统一”只有在实践中统一，自有水到渠成之时，假使伤寒家、温病家都不存在了，都失传了，那还谈得上什么统一呢？何况，在一个学术领域里，存在几个学派没有什么不好。
仲景学说的研究项目，应当纳入国家研究计划，国家课题招标系统中应该设立专门的学科目录，进行专门招标，以资助相关的深入研究。同时，为了有领导、有计划地对某些重点研究项目，组织协作攻关，加强学术交流，中华中医药学会应当设置仲景学说研究会，不能让仲景学说的学术交流长期处于自发的、民办的状态。那些认为，成立了仲景学说研究会，接着就会有孙思邈、张景岳、李东垣……无数个医家的研究会的提出，是一种偏见。首先，仲景学术面临激烈的国际竞争（主要是日本），我们不能在这个领域丧失领先地位；其次，仲景的两部书是本科必修课程，仅此两点已足够说明其必要性了，也是其他任何医家所不能比拟的。1985年“联省”召开的成都仲景会和南阳仲景会，两次会议均属民办性质，从其规模和状况已可见中医同仁的强烈要求了。我们希望全国中医学会，真正成为全国中医之家。
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