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法提取野生刺葡萄基因组

时间:2022-02-17 理论教育 版权反馈
【摘要】:转上清,加入0.6体积-20℃预冷异丙醇, -20℃沉淀DNA 10~30min。待胶液凝固后,将有机玻璃槽取出放入电泳槽内。加样:从每个DNA样品中取5 L,每个加入1L6×Loading-buffer,使其与DNA样品充分混合。
法提取野生刺葡萄基因组_民族地区高校特色

1.2.1 材料预处理

将采摘的刺葡萄嫩叶用自来水清洗,再用蒸馏水清洗几次,正常干燥。

1.2.2 基因组DNA提取

1.2.2.1 试剂的配制

试剂1:高盐TE buffer :10mmol/L TrisHCl( PH8.0 ), 1 mmol/L EDTA( pH8.0), 100mmol/L NaCl。

试剂2: CTAB抽提液:2%(m/V) CTAB, 100 mmol/L Tris·HCl(pH8.0), 20mmol/L EDTA( pH8.0 ), 1.4mol/L NaCl(使用前预热并加2%2-硫基乙醇),后加入2%PVP。

试剂3: 70%乙醇:用100 mL量筒量取70 mL100%的乙醇倒入100 mL容量瓶中,25℃加去离子水定容。

试剂4: CTAB/NaCl溶液:在40 mL水中溶解2.05 g NaCl,缓缓加入5 g CTAB并搅拌,置于65℃水浴锅加热至全部溶解。

试剂5:氯仿/异戊醇抽提液:氯仿,异戊醇(体积比24∶1)。

1.2.2.2 基因组DNA提取

(1)将1g材料(新鲜嫩叶)放入研钵中在-20℃冷却1h,然后快速研磨成粉状。

(2)将粉末放入50 mL离心管中,加入10~15 mL CTAB抽提液,60℃水浴50min,再加入100µL5mol/L NaCl和80µL CTAB/NaCl溶液60℃水浴10min。

(3) 4000rpm离心5min,然后将液相分装到1.5mL离心管(每管大约600µL)。

(4)加入1体积氯仿/异戊醇,混合5min, 13000rpm离心20 min。

(5)取上清,加入1体积氯仿/异戊醇,混合5min, 13000rpm离心20min。

(6)转上清,加入0.6体积-20℃预冷异丙醇, -20℃沉淀DNA 10~30min。

(7) 2700g(g为重力加速度)离心2 min,移除液相。

(8) 70%乙醇洗涤,重复(7),倒扣离心管于滤纸上1h,然后室温或37℃干燥。

(9)用50µLTEbuffer重悬DNA,加入1µL RNase37℃水浴2h(或更长),-20℃冰箱保存或立即做琼脂糖凝胶电泳

1.2.3 电泳检测

凝胶制备:称取0.6g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入100mL0.5×TBE缓冲液,置微波炉加热至完全融化,取出摇匀。待凝胶冷却到60℃时,摇匀缓缓倒入有机玻璃内槽,直到有机玻璃板上形成一层均匀的胶面(不能有气泡)。待胶液凝固后,将有机玻璃槽取出放入电泳槽内。加入电泳缓冲液至电泳槽中使电泳液刚好没过胶面,轻轻取出梳子。

加样:从每个DNA样品中取5 µL,每个加入1µL6×Loading-buffer,使其与DNA样品充分混合。用移液枪将DNA样品加入加样孔(记录点样顺序)。

电泳:接通电泳槽与电泳仪的电源,电泳电压为100V。当溴酚蓝染料移动到凝胶中间时,停止电泳。取出凝胶,置于0.5 µg/mL的EB染液中,室温染色15 min。用去离子水漂洗后放入凝胶成像仪观察。

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