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中国对虾“黄海号”和野生群体不同组织的分析

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:中国对虾具有分布范围广和经济价值高的特性,是中国重要的捕捞和海水养殖对象。中国水产科学研究院黄海水产研究所针对中国对虾快速生长性状进行选育,得到人工选育新品种“黄海1号”。杜盈等利用MSAP 从整个基因组水平上对中国对虾DNA甲基化水平进行研究,分析具有不同生长优势的中国对虾野生群体和中国对虾“黄海1号”肌肉、鳃和血液组织DNA甲基化状态差异,进而从表观遗传学的角度为揭示影响中国对虾生长性状的分子机制奠定基础。

中国对虾具有分布范围广和经济价值高的特性,是中国重要的捕捞和海水养殖对象(岑丰,1993)。自1993年来,虾病暴发引起的优良品种的缺失造成中国对虾养殖业一蹶不振。中国水产科学研究院黄海水产研究所针对中国对虾快速生长性状进行选育,得到人工选育新品种“黄海1号”。到2011年,经过连续15年的选育,该品种仍具有生长速度快,抗逆能力强等优良性状(李健等,2005)。

DNA甲基化是基因表达的重要调控方式,是表观遗传学的研究重点和热点之一。分子遗传学研究表明,DNA胞嘧啶甲基化与基因沉默和基因的差异性表达有关,并且在诸如X染色体失活、细胞分化、基因印记等生物学事件中起到重要作用(Tariq et al,2004)。DNA甲基化检测方法有很多,例如重亚硫酸法、高效液相色谱法(HPLC)、甲基化敏感性扩增多态性(MSAP)、基因测序法等。MSAP 由于重复性好,需样量小,多态性丰富,且对全基因组和片段基因都可以进行检测等优点而广为应用。MSAP是基于AFLP建立起来的,以1对同裂酶Hpa Ⅱ和Msp Ⅰ替代AFLP中的高频酶Mse I,对同一识别序列CCGG进行不同的切割,从而产生不同大小的酶切片段(Monteuuis et al,2008;Zhang et al,2006)。

目前,MSAP 技术已逐渐走向成熟,根据得到的品种间甲基化水平差异性可推测其遗传多态性,从表观遗传的角度解释基因的表达调控特征及机制(Noyer et al,2005;Xiong et al,1999)。该技术现在多应用于樟树(Ocotea catharinensis)(Lui z et al,2010)、水稻(Sha et al,2005)、大花蕙兰(Cymbidium hybridium)(Chen et al,2009)、蝴蝶兰(Doritaenopsis)(Park et al,2009)等植物生长发育过程中基因组DNA的甲基化检测,在对猪(蒋曹德等,2005)、家鸡(班谦等,2009)、鲤鱼(曹哲明等,2010)及软体动物扇贝(吴彪等,2012)等的研究中也多有涉及,但在甲壳动物中却鲜有研究报道。应用MSAP对不同生物体的甲基化研究发现,不同生物体以及同种生物体不同组织的甲基化水平在一定程度上有很大差别,而且在不同生长时期也会有起伏。Lu等(2008)对玉米、曹哲明等(2009)对背角无齿蚌的组织甲基化修饰水平研究中发现,甲基化可能参与到基因的调控中,并且调控程度不同,同时伴随出现高甲基化的表达抑制。杜盈等(2013)利用MSAP 从整个基因组水平上对中国对虾DNA甲基化水平进行研究,分析具有不同生长优势的中国对虾野生群体和中国对虾“黄海1号”肌肉、鳃和血液组织DNA甲基化状态差异,进而从表观遗传学的角度为揭示影响中国对虾生长性状的分子机制奠定基础。

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