中国对虾“黄海号”不同选育群体的遗传距离

表12给出了群体内和群体间的遗传多样性数据。从表中可以看出，随着选育世代的增加，由Shannon指数反映的群体遗传多样性（H9）呈逐渐下降的趋势。5个世代的遗传变异，有92.89%是来源于群体内，只有7.11%是来源于群体间。杂合度的分析结果与Shannon多样性指数的结果一致。

表12　群体内和群体间的遗传多样性

利用POPGENE1.3.1软件计算了5个连续世代之间的Nei遗传相似系数和无偏遗传距离。群体之间的遗传距离介于0.002.8　～ 0.0.4　8之间，其中Pop5与Pop7之间的遗传距离最小（0.0.2　8）；Pop3与Pop7之间的遗传距离最大（0.0.4　8）。随着选育时间的延长，群体内的遗传相似度呈上升趋势。

表13　五个群体的Nei（1972）遗传距离及相似性系数

注：对角线以下为遗传距离，对角线以上为相似性系数

表14　五个群体的多态位点平均杂合度及群体内相似性系数

根据遗传相似系数和遗传距离指数的计算结果，构建了5个世代的UPGMA聚类关系图。第五代和第七代聚为一支，与第六代聚为一大支，然后与第三代和第四代形成的另一支再相聚。

将508个扩增位点的显性基因型频率以10%为单位划分区间，0设为一个单独的区间。由于显性基因型频率为100%的位点数都在280左右，远大于其他区间上的位点数，所以没有将100%作为一个区间，这样划分为11个区间，统计显性基因型频率位于各区间内的位点数。结果如图1所示。5个群体的扩增位点数在不同显性频率区间内的分布呈现一定规律，反映了5个群体的遗传结构特点。在10%～99%区间内5个群体的位点数分布的变化趋势完全一致，说明5个群体的遗传结构非常相近。在0区间内，早期选育群体的显性位点数明显小于后期选育群体，而在1%～9%区间内，则基本相反。

五个世代大部分位点的等位基因频率呈很好的相关性，且随着选育时间的改变而向同一方向变化，以引物E42M48的扩增结果为例（图2），部分位点是随着选育世代的增加其等位基因频率逐渐减小，如位点E42M48-39。另有部分位点的变化趋势则相反，即在定向选育过程中，等位基因频率是逐渐升高的，如位点E42M48-36。