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限制性作图

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:为了得到精确的物理图谱,首先在工作之前对限制酶进行选择是必需的,最好选用那些在DNA链上的切点在20个左右的酶。还要避免选择产生双重带的限制性内切核酸酶。正常情况下,凝胶上的DNA片段的染色强度随相对分子质量减小而递减。其次,DNA分子大小与物理图谱的精确度也有密切关系。
限制性作图_分子生物学实验指

第二节 限制性作图

标明限制性内切核酸酶在DNA分子上的限制位点数目、限制片段大小及其排列顺序的图谱称为DNA的物理图谱,又称限制性作图。组建物理图谱是基因工程研究的重要程序,基因的定位、转录、消化、分离、分子杂交、克隆转化都与物理图谱有直接关系,所以组建物理图谱具有重要意义。

为了得到精确的物理图谱,首先在工作之前对限制酶进行选择是必需的,最好选用那些在DNA链上的切点在20个左右的酶。切点愈多,情况愈复杂,误差也就愈大。还要避免选择产生双重带的限制性内切核酸酶。所谓双重带,即两个片段的大小正好相同,电泳时,它们必然位于同一带位。可以通过染色强度判断双重带。正常情况下,凝胶上的DNA片段的染色强度随相对分子质量减小而递减。如果某个低分子量带的颜色强度反常地高于上带,经荧光比色,其浓度比单一带高出一倍,此即为双重带。其次,DNA分子大小与物理图谱的精确度也有密切关系。太大的DNA(如染色体DNA)难以得到精确的物理图谱。第三,由于几种方法都是以DNA片段大小为基础的,所以在电泳后,要尽可能准确地测定各片段的相对分子量。为了不遗漏小片段(1kb以下的片段在0.7%琼脂糖凝胶上难以观察到),最好能同时进行聚丙烯酰胺凝胶电泳。即使如此,精确度也总是有限的,有时可产生100~200bp的误差。

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