根据国际抗癌协会（UICC）的标准，胆囊癌依其分化程度可分为高分化（G1）、中分化（G2）、低分化（G3）和未分化（G4）癌。
在组织学上，胆囊癌可分为以下几型。
（一）腺癌
最为多见，约占87.1%。其中分化型占腺癌总数的58.7%。多数表面呈乳头状，大多胆囊癌的病理具有腺体形态尚完整，腺腔宽广，腔内尚有一层或多层非典型的立方细胞，呈同心圆排列的特征。从其表面看似乎是腺体结构分化良好，然而细胞的分化却较差。有时可见腺癌扩展至罗－阿窦。电子显微镜下，腺癌细胞呈现多形性微绒毛、黏液空泡和丰富的溶酶体。腺癌细胞产生的黏蛋白主要为涎黏蛋白，其角蛋白和CEA抗原呈强阳性，也有一些胆囊腺癌AFP免疫反应为阳性。而正常、炎症性或梗阻性的胆囊主要分泌的是硫黏蛋白。腺癌的病理类型可分为硬化性腺癌、乳头状腺癌、管状腺癌和黏液腺癌，其中又以硬化性腺癌多见。胆囊腺癌的预后以乳头状腺癌为最好，巨细胞癌的预后最差。
1.硬化型胆囊腺癌 约占60%。病变的胆囊壁增厚变硬，胆囊正常大小或缩小，状如慢性胆囊炎，囊壁纤维组织增生，与癌细胞交织在一起质较硬，癌巢呈大小不等和形态不规则的腺样结构，浸润破坏胆囊壁。癌细胞呈不同程度异型性柱状细胞，分化程度越低则呈多形性梭形细胞癌结构。该型早期易误诊为慢性胆囊炎，多见于60－80岁的女性病人，大多合并有胆囊结石，80%位于胆囊底部。
2.乳头状胆囊腺癌 约占20%。部分为乳头状瘤或息肉恶变而来。其镜下特征为大量基质被柱状细胞所包绕。乳头型的瘤体突入腔内，边缘往往为分叶状。此型肿瘤生长较缓慢，质地较软，表面多有溃疡，乳头易发生感染、坏死和出血。癌细胞呈圆柱状，分化较好，转移较迟。
3.黏液性腺癌 约占10%。肿瘤松软呈胶胨状，往往在发现时已有胆囊壁的广泛转移，胆囊壁常因肿瘤的破溃而穿孔，腺癌细胞可分泌黏液和出现黏液样变性，癌细胞浆和腺腔内充满假黏液蛋白使细胞核被挤向胞内的一侧而呈指环状，即印戒细胞癌。
4.管状腺癌 约占10%。镜下见肿瘤的腺腔呈管状排列，由大量的高柱状细胞和立方形细胞组成腺腔的腔壁。
（二）未分化癌
分为间变型、多形性、梭形和肉瘤样4型。从形态学角度又可分为巨细胞型和梭形细胞型。大体上与肉瘤很相似。甚至会出现癌和肉瘤双向分化的肿瘤——癌肉瘤。其恶性程度高，预后差。约占10%。
（三）腺鳞癌
病理特点为腺癌组织中含有较大量的鳞状细胞。较少见，约占3%。
（四）鳞癌
由胆囊黏膜鳞状上皮化生后癌变而形成，或由胆囊黏膜的多能性基底细胞发生。肉眼观鳞癌多为灰白色呈广泛浸润的肿块，鳞癌一般由化生的鳞状上皮恶变而来。根据鳞状上皮分化的程度不同可分为腺棘皮癌，腺鳞癌。鳞癌占2%～3%。腺棘皮癌0.08%。鳞状上皮癌多为浸润型。常侵犯整个胆囊壁，为实体癌。镜下有不同分化程度的鳞癌特征，可见角化珠，癌巢，细胞间有细胞间桥。
其他罕见类型包括类癌、肉瘤、癌肉瘤、恶性组织细胞瘤、黑色素瘤、恶性淋巴瘤、透明细胞癌和横纹肌母细胞瘤等。Johnstone曾报道胆囊燕麦细胞癌，这种类型罕见且侵袭性很强。此型癌细胞外形类似肺的燕麦细胞癌，有神经内分泌颗粒。燕麦细胞癌常见于有胆石症的老年女性，病情呈暴发性且伴广泛转移，肝脏转移最多见。平均生存时间少于7个月。
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