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蛋白质分子中氨基酸的排列顺序

时间:2022-04-18 理论教育 版权反馈
【摘要】:并不是所有的蛋白质都有四级结构。此外,蛋白质分子中所有二硫键的位置也属于一级结构范畴。已有大量实验结果证明,一级结构相似的多肽或蛋白质,其空间构象以及功能也相似。在某些物理或化学因素作用下,蛋白质特定的空间结构破坏,导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,称为蛋白质的变性。变性后,蛋白质溶解度下降,黏度增加,结晶能力消失,生物活性丧失,易被蛋白酶水解。

本节热门考点

1.氨基酸的分类:其中酸性氨基酸有天冬氨酸、谷氨酸;碱性氨基酸有赖氨酸精氨酸组氨酸

2.蛋白质的结构:一级结构的主要化学键是肽键。二级结构主要掌握α螺旋,维系蛋白质二级结构的因素是氢键。并不是所有的蛋白质都有四级结构。

3.蛋白质的理化性质:溶液pH>pI时蛋白质带负电,溶液pH<pI时蛋白质带正电。

一、氨基酸与多肽

(一)氨基酸的结构与分类

蛋白质的元素组成相似,主要有碳、氢、氧、氮和硫。各种蛋白质含氮量很接近,平均为16%。

1.氨基酸的结构 氨基酸是组成蛋白质的基本单位。组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,而且均属L-α-氨基酸(除甘氨酸外)。连在-COO基上的碳称为α-原子,为不对称碳原子(甘氨酸除外)。不同氨基酸的侧链(R)各异。

2.分类 根据侧链的结构和理化性质可分为四类。①非极性、疏水性:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸;②极性中性:丝氨酸、半胱氨酸蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸;③酸性:天冬氨酸、谷氨酸;④碱性:赖氨酸、精氨酸、组氨酸。

(二)肽键与肽链

1.肽键 由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而形成的酰胺键,称肽键。

2.肽链 由两分子氨基酸脱水缩合成最简单的二肽,二肽通过肽键与另一个氨基酸缩合生成三肽,此反应可依次生成四肽、五肽……。由十个以内氨基酸相连而形成的肽称为寡肽,由更多的氨基酸相连而形成的肽称为多肽。肽链分子中的氨基酸相互衔接,形成的长链,称为多肽链。多肽链有两端。N-端:自由氨基的一端。C-端:自由羧基的一端。

二、蛋白质的结构

(一)一级结构

在蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构。一级结构的主要化学键是肽键。此外,蛋白质分子中所有二硫键的位置也属于一级结构范畴。

(二)二级结构

蛋白质的二级结构是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就是该肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。主要包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲。主要化学键是氢键。

α-螺旋:在α螺旋结构中,多肽链的主链围绕中心轴作有规律的螺旋式上升,螺旋的走向为顺时针方向,右手螺旋。氨基酸侧链伸向螺旋外侧。每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距为0.54nm。α-螺旋的每个肽键的N-H和第四个肽键的羰基氧形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴基本平行。肽链中的全部肽键都可形成氢键,以稳固α-螺旋结构。

(三)三级和四级结构

1.蛋白质的三级结构 是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。蛋白质三级结构的形成和稳定主要靠次级键——疏水作用、离子键、氢键和Van der Waals力等。

2.蛋白质的四级结构 蛋白质的二级、三级结构只涉及由一条多肽链卷曲而形成的蛋白质。而有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条具有完整的三级结构的多肽链称为蛋白质的亚基,蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。亚基之间的结合力主要是氢键和离子键。

三、蛋白质结构与功能的关系

(一)蛋白质一级结构与功能的关系

已有大量实验结果证明,一级结构相似的多肽或蛋白质,其空间构象以及功能也相似。但是,有时蛋白质分子中起关键作用的氨基酸残基缺失或被代替,都会影响空间构象乃至生理功能,甚至导致疾病的产生。这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,被称为“分子病”,其病因为基因突变所致。

(二)蛋白质高级结构与功能的关系

肌红蛋白(Mb)和血红蛋白(Hb)为例阐述蛋白质的空间结构与功能的关系。

1.Mb和Hb都是含有血红素辅基的蛋白质,Mb是一个只有三级结构的单链蛋白质,Hb具有4个亚基(α2β2)组成的四级结构,一分子Hb共结合4分子氧。

2.Mb和Hb均与O2可逆性结合,Mb与O2结合曲线呈直角形,Hb与O2结合曲线呈S形。根据S形曲线的特征可知,Hb中第一个亚基与O2结合以后,促进第二及第三个亚基与O2结合后,又促进第四个亚基与O2结合,称为正协同效应。协同效应的定义是指一个亚基及其配体结合后,能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合能力,如果是促进作用称为正协同效应,反之则为负协同效应。

四、蛋白质的理化性质

(一)蛋白质的等电点

蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。蛋白质溶液的pH大于等电点时,该蛋白质颗粒带负电荷,反之则带正电荷。

(二)蛋白质的变性

在某些物理或化学因素作用下,蛋白质特定的空间结构破坏,导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,称为蛋白质的变性。主要发生二硫键和非共价键的破坏,不涉及一级结构中氨基酸序列的改变。变性后,蛋白质溶解度下降,黏度增加,结晶能力消失,生物活性丧失,易被蛋白酶水解

(三)蛋白质的沉淀

蛋白质变形后,疏水侧链暴露,肽链融汇相互缠绕而聚集,因而从溶液中析出,这一现象称为蛋白质沉淀。变性蛋白质容易沉淀,但有时蛋白质沉淀并不是变性。

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