SEM模型结果显示，在京津冀协同创新网络中，企业—政府以及企业—企业关系网络是影响创新效率的主要因素，但是此结果只能表明潜变量之间的关系，而无法说明各个解释变量的显变量对于被解释变量的影响。为了更进一步说明协同创新网络对于创新效率的影响，本文采用层次回归分析（MANCOVA）方法对修正后的模型进行分析（见表4）。其中被解释变量创新效率的显变量包括企业研究与开发投入产出情况（VAR4）、企业新产品投入产出情况（VAR8）及企业新产品收入在主营业务收入中的比重（VAR12）。
表4 京津冀协同创新网络层次回归析分析表
注：***表示在<0.001水平上显著，**表示在<0.01水平上显著，*表示在<0.05水平上显著。
图3 模型3的残差分布图
在特征值大于0.01以及条件索引值都小于30的前提下，自变量间的共线性问题才能被忽略，因此表明有关被解释变量的模型1都是不成立的，而模型2尽管成立，但是其值小于模型3（见表4）。模型3的残差分布情况较好，基本不存在自相关现象，因此模型3的回归结果质量较高（见图3）。综合以上研究结果，相对于模型1和模型2，模型3是解释创新效率变量的最优形式。
综合影响因子以及显著系数的测算结果，可知与零售商之间的关系、与供应商之间的关系以及政府的科技投入等变量对企业研究与开发投入产出情况具有显著正向影响。这表明企业研究与发展能力不仅需要企业自身技术水平、人员素质以及生产设备水平的提高，同时也需要政府扶持和帮助，尤其是政府对企业的科技投入。企业通过不断加强与供应商和销售商的关系，可以提升企业有关产品和服务的信息在上游企业和下游企业之间的流动能力，促使企业间进行重复性交易，减少供应商与销售商的数量，发挥非正式契约关系的作用，形成“纵向一体化”效应，这对于提高企业生产和销售能力、降低企业交易费用以及促使企业资源溢出内部化具有重要意义。
对企业新产品投入产出情况变量有显著正向影响的是与供应商之间的关系、政府的科技投入以及政府制定制度的完善等变量，另外与零售商之间的关系及政府政策的支持等变量对其也具有影响，但是影响因子较小，显著性也较差。与销售商之间关系的改善对于了解客户需求以及市场动态具有重要作用，这是企业进行新产品研发、提高销售绩效的方向和动力。企业研发的新产品在设计和功能上要体现市场预期，这要求企业使用品质较优的零部件，而现今大规模的个性化需求使得零部件的重复使用率较低，这就为企业库存管理和控制带来较大难度，因此寻求稳定的供应商，对于企业提高产品质量、增加企业生产边际效益、提高企业竞争力十分重要。政府通过对企业的直接资助（例如研发补贴）和间接扶持（例如政府购买）降低企业生产边际成本，拓宽企业融资渠道，减少产品生产过程风险；通过向企业提供生产和服务所必需的关键和共性技术，降低企业新产品生产过程中面临的不确定性，提高企业新产品的生产效率。
对新产品收入在主营业务收入中的比重变量有显著正向影响的是与竞争企业之间的关系、与零售商之间的关系、政府政策的支持以及政府制定制度的完善等变量。与竞争企业之间竞合关系的加强有利于企业对所在行业的发展现状以及自身产品的生命周期进行深入的认识，随着企业原有产品逐步从成熟期转入衰退期，新产品逐渐成为企业发展和主营业务的重心，但新产品的市场准入门槛较高，企业进行新产品市场开发和提高新产品市场份额需要与竞争企业之间的合作，这可以与竞争企业形成能力的互补性，降低新产品发展的路径依赖性、市场的重叠性以及企业生产成熟产品的资产专用性，形成有效的企业网络。与零售商之间关系的加强，有利于形成和谐的商业和个人关系以及市场知识在营销渠道中的互动和转移，为新产品的销售减少了交易成本，拓宽了自身的营销渠道。在新产品开发过程中，政府采购是一种促进企业新产品发展、提升新产品形象以及提高新产品市场份额的有效途径，尤其是通过绿色采购，对于引导企业发展绿色产品、激励企业进行绿色生产具有重要作用。政府通过完善制度和实行有效政策，可以降低新产品生产过程中的创新风险、销售过程中的道德风险以及溢出效应，减少企业与其销售对象之间的契约成本，激发企业进一步投入的积极性，增强企业新产品的营销效率，提高企业新产品收入的绝对量，提升新产品在企业发展中的重要性和企业的自主创新能力。
需要注意的是，建立某企业与其他创新主体之间的协同创新关系，要注意“弱关系”（非正式关系）在协同创新网络中的作用，某企业所在的网络节点所涉及的“弱关系”越多，“结构洞”越大，其在网络中的生态位层次就越高，此节点就会逐渐演化成协同网络的核心节点，基于契约成本和资产专用性的考虑，其他网络节点会紧紧嵌入在以核心节点为中心的协同创新网络中。
综合SEM以及层次回归分析计算的结果，可得修正后模型中各个显变量之间所构成的协同创新网络关系（见图4）。其中变量之间距离越长，则表示其关系系数越大，影响越显著。
图4 京津冀协同创新网络变量关系图
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