一、事业单位会计制度
本制度适用于国有事业单位，事业单位有关基本建设投资的会计核算，按有关规定执行；已纳入企业会计核算体系的事业单位，按有关企业会计制度执行。与行政单位会计相同，国有事业单位会计也分为主管会计、二级会计和基层会计等三级单位。事业单位会计核算的一般原则、会计要素、结算和结账和会计报表及其编审，与行政单位会计要求是相似的。此外，事业单位有经营活动的，其经营支出与相关收入应当配比；对于国家指定用途资金，应按规定用途使用，并单独核算反映。会计报表应全面反映事业单位的财务收支情况及结果，对于重要业务事项，应单独反映。
事业单位会计要素与前述财政总预算会计要素是一样的，包括资产、负债、净资产、收入和支出。事业单位会计报表是反映事业单位财务状况和收支情况的书面文件，是财政部门和上级单位了解情况、掌握政策、指导单位预算执行工作的重要资料，也是编制下年度单位财务收支计划的基础。年度财务报告，包括资产负债表、收入支出表、有关附表如专项资金收支情况表，以及财务情况说明书。会计报表要层层汇总，上级单位要在编制本级会计报表的基础上，根据本级会计报表和经审查过的所属单位会计报表，编制汇总会计报表，并将上下级之间的对应账户数字冲销后，逐级汇总上报。
会计报表分为月报、季报和年报（决算）三种。年报应按财政部决算通知规定及主管部门要求的格式和期限报出，并应抄报同级国有资产管理部门。财务分析的内容包括预算执行、资产使用、支出状况等，分析指标包括经费自给率、人员支出与公用支出分别占事业支出的比率、资产负债率等。
二、民间非营利组织会计制度
本制度适用于在各类民间NPO组织，包括社会团体、基金会和民办非企业单位如寺院、宫观、清真寺、教堂等。NPO组织应符合以下条件：一是不以营利为目的；二是任何单位或个人不因为出资而拥有NPO组织的所有权，收支结余不得向出资者分配；三是NPO组织一旦进行清算，清算后的剩余财产应按规定继续用于社会公益事业。NPO组织会计的会计分期、会计期间、记账本位币、记账方法、外币折算和核算原则，与企业会计和预算会计的要求基本是一致的。会计确认基础为应计制，计量基础是历史成本计价，同时对特殊交易事项如捐赠、政府补助等，可采用公允价值等其他计量基础。会计要素分为资产、负债、净资产、收入和费用等五要素。
1．资产。资产应按流动性分为流动资产、长期投资、固定资产、无形资产和受托代理资产。NPO应定期或至少于每年年度终了，对短期投资、应收款项、存货、长期投资等资产是否发生减值进行检查，如这些资产发生了减值，应计提减值准备，确认减值损失，并计入当期费用。对于固定资产、无形资产等其他资产，如果发生了重大减值，也应计提减值准备，确认减值损失，并计入当期费用。如已计提减值准备的资产价值在以后会计期间得以恢复，则应在该资产已计提减值准备的范围内部分或全部转回已确认的减值损失，冲减当期费用。
2．负债和净资产。负债应按其流动性分为流动负债、长期负债和受托代理负债。净资产，是指资产减去负债后的余额。净资产应按其是否受到限制，分为限定性净资产和非限定性净资产等。如果资产或资产所产生的经济利益（如资产的投资收益和利息等）的使用受到资产提供者或者国家有关法律、行政法规所设置的时间限制或（和）用途限制，则由此形成的净资产即为限定性净资产，国家有关法律、行政法规对净资产的使用直接设置限制的，该受限制的净资产亦为限定性净资产；除此之外的其他净资产，即为非限定性净资产。
如果限定性净资产的限制已经解除，应对净资产进行重新分类，将限定性净资产转为非限定性净资产。当存在下列情况之一时，可以认为限定性净资产的限制已经解除：（1）所限定净资产的限制时间已经到期；（2）所限定净资产规定的用途已经实现（或者目的已经达到）；（3）资产提供者或者国家有关法律、行政法规撤销了所设置的限制。如果限定性净资产受到两项或两项以上的限制，应在最后一项限制解除时，才能认为该项限定性净资产的限制已经解除。
3．收入和费用。收入是指为开展业务活动，依法取得的非偿还性资金，包括捐赠收入、会费收入、提供服务收入、政府补助收入、投资收益、商品销售收入等主要业务活动收入和其他收入等。收入应区分为非限定性收入和限定性收入进行核算。如果资产提供者对资产的使用设置了时间限制或者（和）用途限制，则所确认的相关收入为限定性收入；除此之外的其他收入，为非限定性收入。会费收入、提供服务收入、商品销售收入和投资收益等一般为非限定性收入，除非相关资产提供者对资产的使用设置了限制。捐赠收入和政府补助收入，应视相关资产提供者对资产的使用是否设置了限制，分别限定性收入和非限定性收入进行核算。期末，应将本期限定性收入和非限定性收入分别结转至净资产项下的限定性净资产和非限定性净资产。
费用包括业务活动成本、管理费用、筹资费用和其他费用等。期末，应将本期发生的各项费用结转至净资产项下的非限定性净资产，作为非限定性净资产的减项。NPO组织的工资比照事业单位工资标准执行，缴纳的社会保障费应按国家和省级人民政府规定标准执行，并应分别按工资总额14%、1．5%、2%提取职工福利费、职工教育经费和职工工会经费。
4．财务报告。它是反映NPO组织财务状况、业务活动情况和现金流量等的书面文件。财务报告由会计报表、会计报表附注和财务情况说明书组成。NPO组织向外提供的会计报表至少应包括：资产负债表、业务活动表和现金流量表。
会计报表附注至少应包括下列内容：（1）重要会计政策及其变更情况的说明；（2）董事会（或者理事会或者类似权力机构）成员和员工的数量、变动情况以及获得的薪金等报酬情况的说明；（3）会计报表重要项目及其增减变动情况的说明；（4）资产提供者设置了时间或用途限制的相关资产情况的说明；（5）受托代理交易情况的说明，包括受托代理资产的构成、计价基础和依据、用途等；（6）重大资产减值情况的说明；（7）公允价值无法可靠取得的受赠资产和其他资产的名称、数量、来源和用途等情况的说明；（8）对外承诺和或有事项情况的说明；（9）接受劳务捐赠情况的说明；（10）资产负债表日后非调整事项的说明；（11）有助于理解和分析会计报表需要说明的其他事项等。
财务情况说明书至少应对下列情况作出说明：（1）NPO的宗旨、组织结构以及人员配备等情况；（2）NPO的业务活动基本情况，年度计划和预算完成情况，产生差异的原因分析，下一会计期间业务活动计划和预算等；（3）对NPO业务活动有重大影响的其他事项等。
NPO对外投资，而且占对被投资单位资本总额50%以上（不含50%），或虽然占该单位资本总额不足50%但具有实质上的控制权的，或对被投资单位具有控制权的，应编制合并会计报表。年度财务会计报告至少应于年度终了后4个月内对外提供；如被要求对外提供中期财务会计报告的，应在规定的时间内对外提供。
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