通过以上分析，可从五个方面考虑科技企业孵化器管理绩效评价指标体系的设计，如表6-1所示。
1．运营与发展能力
毕业企业是孵化器的产品，新创企业的成功毕业是孵化器作用得到发挥的最重要体现。设立孵化器的目的就是要扶持新创办的高新技术小企业，使其在孵化器中发展壮大以至能在市场中独立生存，从而毕业。为此选用孵化企业成功毕业率，这一指标是指当年成功毕业的企业占孵化企业的百分比。这一指标能充分体现孵化器的孵化功能。
经费自给率是指孵化器年经营性收入占年运营开支的比率，是评价企业孵化器在运营过程中能否筹集到足够的经费支持其正常运营，确保其功能得以顺利发挥的重要指标。
孵化效益是用孵化企业单位孵化场地面积创造的科工贸收入来表示，这一指标是从侧面来衡量孵化器孵化功能发挥的状况。
孵化器是把科研成果变为上市商品、把发明构想变为现实、把创业宏图变为生产公司的地方，是高新区的重要组成部分。所以我们选用科技企业孵化器内孵化企业数来评价孵化器的现状，用孵化器内毕业企业的总收入来评价孵化器的孵化效率，进而体现出孵化器的运营与发展能力。
科研成果转化率是以孵化企业转化科研成果总数与孵化器全部职工数的比例来衡量的。孵化器的功能就是扶持新创办的高科技小企业，促进科研成果的转化，因此转化科研成果是孵化功能发挥的一个主要方面。
员工素质结构是指本科以上人员数占年末从业人员数的比例，这个指标是从学历角度来衡量孵化器的人员素质，从而间接反映出孵化器提供服务的质量。
表6-1 科技企业孵化器管理绩效评价指标体系
高新技术企业比例体现孵化器的未来发展方向，是反映孵化器产业化发展的重要指标。这一指标是以在孵高新技术企业总数占入孵企业总数的比例来表示的。
企业存活率是指毕业5年内仍在工商注册的企业数目占毕业企业总数的比例。这一指标主要是考察入孵企业从孵化器毕业后是否真正具备了独立的生存能力，从另一个侧面判断孵化器提供孵化服务的质量。
2．技术创新能力
科技创新基金投入率是指科技创新基金占财政支出的比重，体现了高新区对孵化企业技术创新支持的力度。
技术开发成果数体现了孵化器科技开发所取得的成效。由于我国目前孵化企业的产品还有不少属于加工层次，因此强调这一指标对于我国企业自主研发，提高技术创新能力意义重大。
科技创新的人员数比例是指从事科技创新的人员数占年末从业人数的比重。从事科技创新人员数量的多少对于技术创新能力建设来说较为重要。这一指标也被一些西方国家用来判断企业是否属于高新技术产业。
由于高新技术生命周期大大缩短，要求孵化器内工作人员的知识和技能较快地适应高新技术迅速发展的需要，所以对人员的培训十分重要，因而将人员培训列为体现孵化器技术创新能力的指标。
产学研联系程度，对于当地大学和科研院所少、自身缺乏创新后劲的企业提升其技术创新能力尤为重要，因此将产学研合作项目数列为评价技术创新能力的指标之一。
风险投资对于初创时期或快速成长时期的新创企业的发展起着十分重要的作用，因此将风险投资总额作为评价孵化器技术创新能力的一个指标。
3．社会贡献
上缴税费总额是指科技企业孵化器每年向国家和地方缴纳的各项税费的总和。
技工贸总收入反映了孵化器建立以来达到的经济规模，从总体上反映孵化器的管理业绩。
年末从业人员总数是一个绝对指标，反映孵化器的总体实力，包括科学家、工程师、技术员和辅助人员，同时反映孵化器对社会发展的贡献。
工业增加值占所在区域工业增加值的比例反映了孵化器对所在区域贡献的大小。
以上四项指标体现了孵化器对国家和地方经济发展、增加就业等方面所做的贡献。
4．创业环境
创业环境是孵化器建设的一个关键因素，它涉及物业管理、提供廉价活动场所、吸引人才、政府支持、资金运作、办事效率以及信息网络建设等主要因素。其中，硬件设施建设费用占支出费用的比例可以从整体上考察孵化器建设的总体情况和规模，是体现孵化器发展潜力的重要因素。软环境建设状况包括政策、法规、管理体制等，是体现孵化器发展潜力的重要因素。由于制度涉及面较广，如把相关内容一一列为指标，将使指标量太大，同时有些指标难以量化，所以笼统制定一个定性指标，凭相关资料整理归纳，加上实地考察后作出判断。
当地大学和科研院所数量是一个绝对指标，一定程度上反映了孵化器所在地区的科技实力。
5．国际开放程度
对于处于经济全球化下的企业孵化器来说，对外开放显得很有必要。这里用了四个绝对指标来反映孵化器对外开放的成效，它们是出口创汇额、引进留学归国人员及海外专家数、国际合作合资项目数、实际到位外资数。
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