为保证整个流程处于检查、控制、协调和改进的管理之下，实施流程管理前必须确定流程的所有者和流程管理组织，保证有专人对规定范围内的流程负责，有专门的组织负责对整个流程进行管理和协调。
一般情况下，医院基本流程所有者、设计者为医院院长；医院跨部门流程所有者、设计者及执行者为医院部门领导；科室流程所有者、设计者及执行者为科室领导。
流程所有者的责任是确定流程的界限、设计规定范围内的业务流程、协调业务流程接口、确定子流程并指定子流程所有者、规定业务流程的输出、监督业务流程的运行效果、改进业务流程以及按规定时间向流程管理部门提交“流程失效和缺陷信息报告”等。
流程管理部门一般可由医院质量控制部门担任，它的主要职责包括：
1.建立流程管理制度 流程管理制度是流程运行的规范。绘制流程图，编制流程程序文件，设计流程记录单，制定流程标准，建立流程管理制度，是流程管理的核心工作。
2.记录流程运行状态 包括获取顾客对流程的评价信息、记录流程运行状态、分析流程的失效和缺陷信息等。
3.测量、评估流程运行质量 要制定流程测评的方法，使流程输入、流程运行、流程输出等流程指标处于受控状态。
4.流程质量审核 流程质量审核是一种流程运行跟踪，目的是加强流程执行力度，寻找流程优化的机会。它包括对所有业务流程的独立检查，审核的内容为：所有员工是否严格按照流程规范工作，是否超出流程中规定的时间指标要求等。
5.流程的优化 流程优化是组织渐进式绩效改善工作，是流程管理的基本活动。定期评估所有的流程，从不同的角度审视流程问题，实施流程优化提高流程质量。
6.流程描述 建立由对流程中每个方面都详细了解的人员所组成的项目小组，完成流程图。流程的所有者必须参加流程图的绘制。
7.流程质量评审 对每个新设计的流程及每一次的流程优化都要进行流程质量评审。评审的内容主要是审查流程设计是否遵循了流程设计的原则，如是否遵照法律法规，是否符合顾客满意原则，是否充分利用了企业的资源，流程的效率和响应速度是否还有提升的机会等。
8.人员培训 定期对影响流程质量的所有人员进行流程管理知识的培训。
9.流程文档的管理 包括流程质量记录、审核记录、评审记录、变更记录等文档的管理。
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