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降解法测定糖链的序列

时间:2022-02-11 百科知识 版权反馈
【摘要】:实验三 Smith降解法测定糖链的序列学习和掌握Smith降解法测定糖链序列的原理和方法。3.以1→4位键结合的糖基经高碘酸氧化,平均每个糖基仅消耗一分子高碘酸,并且无甲酸释放;Smith降解后产生赤藓醇。本实验通过纸层析检测终产物中的甘油、赤藓醇和糖。多糖在浓硫酸中保温一定时间可完全水解为单糖,通过纸层析分离,特定试剂显色后与已知糖的标准混合物作对比,可以鉴定多糖水解产物中单糖的组成。
降解法测定糖链的序列_生物化学实验指导

实验三 Smith降解法测定糖链的序列

【实验目的】

学习和掌握Smith降解法测定糖链序列的原理和方法。

【实验原理】

Smith降解是将高碘酸氧化产物用硼氢化合物(如硼氢化钾或硼氢化钠)还原成稳定的多羟基化合物,然后进行适度的酸水解,用纸层析鉴定水解产物,由水解产物可以推断多糖各组分的连接方式及次序。以葡聚糖为例:

1.以1→2位键结合的糖基经高碘酸氧化,平均每个糖基仅消耗一分子高碘酸,并且无甲酸释放;Smith降解后产生甘油。

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2.以1→3位键结合的糖基不被高碘酸氧化;Smith降解后仍为原来的糖。

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3.以1→4位键结合的糖基经高碘酸氧化,平均每个糖基仅消耗一分子高碘酸,并且无甲酸释放;Smith降解后产生赤藓醇。

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4.以1→6位键结合的糖基或非还原末端基(1→6)经高碘酸氧化,消耗二分子高碘酸,同时释放一分子甲酸;Smith降解后产生甘油。

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本实验通过纸层析检测终产物中的甘油、赤藓醇和糖。在降解产物中若有赤藓糖生成,则提示多糖具有1→4结合的糖苷键;若有甘油生成,则提示有1→6、1→2结合的糖苷键或有还原末端葡萄糖残基;若能检出单糖,如葡萄糖、半乳糖、甘露糖等,则有1→3糖苷键结合的存在。

多糖在浓硫酸中保温一定时间可完全水解为单糖,通过纸层析分离,特定试剂显色后与已知糖的标准混合物作对比,可以鉴定多糖水解产物中单糖的组成。

【药品试剂】

1.0.1 mol/L醋酸

2.2 mol/L硫酸、1 mol/L硫酸。

3.硼氢化钾。

4.纸层析试剂:

(1)标准糖溶液:称取一定量的半乳糖、葡萄糖、甘露糖、阿拉伯糖,用蒸馏水溶解,得标准糖混合溶液(每种糖的点样量为20~30μg)。

(2)展层剂:正丁醇∶乙酸:水=4∶1∶5。

(3)显色剂:苯胺-邻苯二甲酸-正丁醇饱和水溶液(邻苯二甲酸1.6 g溶于水饱和的正丁醇100 ml,加苯胺0.93 g,相当于苯胺0.9 ml)。

5.BaCO3

6.硝酸银显色剂:

(1)16%硝酸银水溶液:丙酮为1∶9(V/V)。

(2)1%NaOH乙醇溶液(W/V)。

(3)6 mol/L氢氧化铵。

【实验器材】

水解管、滤纸、玻璃毛细管、层析缸、喷雾器。

【实验方法】

1.还原和水解:将高碘酸氧化后经乙二醇处理的溶液用对流水透析48小时,然后用蒸馏水透析24小时,于40℃以下减压浓缩至10 ml左右,加入70 mg硼氢化钾,于室温、暗处搅拌18~24小时以还原多糖醛。用0.1 mol/L醋酸中和至pH6~7,用对流水透析48小时,然后用蒸馏水透析24小时,减压蒸干,加1 mol/L硫酸2 ml,封管,100℃水解8小时,用碳酸钡(BaCO3)粉末中和,定量滤纸过滤,滤液减压浓缩后,通过纸层析方法检测。

2.纸层析:将层析滤纸剪成7 cm×40 cm的纸条,距层析滤纸一端2 cm处画一横线作为点样线,在点样线上画两个点分别作为标准糖溶液和多糖水解液的点样位置。用玻璃毛细管点样,斑点尽可能小,而且每点一滴,待点样点干燥后,在同一位置再点第二滴。然后将滤纸条悬挂于层析缸中进行层析,展层时间约为36小时。

展层后,将滤纸取出,干燥,喷上硝酸银显色试剂(1),自然干燥,将滤纸浸入硝酸银显色试剂(2)中,待斑点显出后,再浸入硝酸银显色试剂(3)中以洗去滤纸上的氧化银,然后用水冲洗1小时左右,风干。

3.纸层析结果分析:记录各斑点的位置,绘出层析图谱。根据各显色斑点的颜色相对位置,测算Rf值。以正丁醇∶乙酸∶水=4∶1∶5为展层剂时,甘油的Rf值为0.48,赤藓醇的Rf值为0.35。

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【思考题】

Smith降解法测定糖链序列的原理是什么?

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