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核糖体亚基的合成在哪发生

时间:2022-02-11 理论教育 版权反馈
【摘要】:氨基酸必须通过活化才能参与蛋白质的生物合成。活化反应由氨基酰-tRNA合成酶催化,生成相应的氨基酰-tRNA,同时消耗2个来自ATP的高能磷酸键。肽链延长在核糖体上连续循环进行,称为核蛋白体循环,每次循环使多肽链增加一个氨基酸。电镜观察发现,在蛋白质生物合成的过程中,每条mRNA模板都可同时附着多个核糖体,形成一种串珠样的结构,称为多聚核糖体。这种多聚核糖体的形成,大大提高了mRNA的利用率和蛋白质生物合成的速度。

原核生物和真核生物的蛋白质生物合成过程基本相似。这里以E.coli的翻译过程为例进行介绍。

(一)氨基酸的活化与转运

氨基酸必须通过活化才能参与蛋白质的生物合成。活化反应由氨基酰-tRNA合成酶催化,生成相应的氨基酰-tRNA,同时消耗2个来自ATP的高能磷酸键。活化反应如下:

书写氨基酰-tRNA时,用氨基酸三字符代表已结合的氨基酸,右上角的缩写代表tRNA所结合氨基酸的特异性,如Gly-tRNAGly、Cys-tRNACys等。转运起始氨基酸的tRNA称为起始tRNA(tRNAi)。由于起始密码子AUG代表甲硫氨酸,故真核起始tRNA为Met-tRNAiMet。在原核生物中,起始tRNA携带的甲硫氨酸需要甲酰化,用fMet-tRNAifMet来表示。

(二)多肽链合成过程

通常将多肽链合成过程分为起始、延长和终止3个阶段。

1.肽链合成的起始 是指由核糖体大、小亚基,模板mRNA及起始氨基酰-tRNA组装形成翻译起始复合物的过程,此过程需GTP、3种IF及Mg2+的参与。

(1)核糖体大小亚基的解离:在IF1和IF3的作用下,核糖体大、小亚基解离,为mRNA和起始氨基酰-tRNA与小亚基的结合作好准备。

(2)mRNA在30S小亚基上定位:原核生物mRNA在小亚基上定位依赖以下两种机制:一是mRNA 5′-端起始密码子的上游有一段富含嘌呤的SD序列(Shine-Dalgarno sequence)与核糖体小亚基上16SrRNA 3′-端富含嘧啶的序列辨认结合;二是mRNA上紧接SD序列后的核苷酸序列可被核糖体小亚基蛋白识别。通过上述RNA-RNA和RNA-蛋白质的相互作用,mRNA的起始密码得以在核糖体小亚基上准确定位。

(3)fMet-tRNAifMet的结合:fMet-tRNAifMet和与GTP结合的IF2形成复合体,然后与核糖体小亚基结合,使fMet-tRNAifMet定位于起始密码子的相应位置。

(4)50S大亚基结合:30S小亚基、mRNA和fMet-tRNAifMet结合完成后,IF3从小亚基上脱落,同时GTP被水解,使IF1和IF2也相继脱落。50S大亚基结合到30S小亚基上,形成70S起始复合物。此时fMet-tRNAifMet占据核糖体的P位,A位空缺(图9-19)。

2.肽链的延长 是指在多种延长因子(EF)的作用下(表9-4),各种氨基酰-tRNA按mRNA上遗传密码的指导在核糖体上依次缩合形成肽键,使多肽链不断延伸,这是肽链合成的主要过程。肽链延长在核糖体上连续循环进行,称为核蛋白体循环,每次循环使多肽链增加一个氨基酸。每次循环又可分为进位、成肽和转位三步。

表9-4 原核生物翻译延长因子及其生物功能

(1)进位:又称注册。在起始复合物形成后,核糖体的P位已被fMet-tRNAi fMet占据,A位空缺(图9-20)。按照A位上对应的mRNA第2个密码子,相应的氨基酰tRNA与EF-Tu/GTP构成复合物,并通过其反密码子识别mRNA模板上的密码子而进入A位。然后,EF-Tu水解GTP转变为EF-Tu/GDP复合物,驱动EF-Tu和GDP从核糖体释放,最后与EF-Ts重新生成EF-T而被利用。

(2)成肽:在大亚基上肽酰转移酶的催化下,P位上起始tRNA所携带的甲酰甲硫氨酰基与A位上新进入的氨基酸的氨基缩合形成第一个肽键,从而在A位上形成二肽酰-tRNA。

(3)转位:延长因子EF-G具有转位酶活性,可利用GTP水解提供的能量,推动核糖体沿mRNA从5′-端向3′-端移动一个密码子。此时,肽酰-tRNA及其相应的密码子从A位移到P位,空载的tRNA移至E位而被排出,mRNA模板的下一个密码子进入A位,为下一个相应氨基酰-tRNA的进入做好了准备。

图9-19 原核生物翻译起始过程

3.肽链合成的终止 当终止密码出现在核糖体的A位时,只有释放因子(RF)能识别这一位点并与之结合,而其他氨基酰-tRNA不能再进入这一位点,故肽链的延伸就此终止。原核生物有三种RF,RF1能识别终止密码子UAA、UAG,RF2能识别UAA、UGA。RF3是依赖核糖体的GTPase,能帮助RF1或RF2进入A位,并帮助合成完的多肽链从P位上的tRNA释放出来。随后由GTP提供能量,tRNA及RF被释放,核糖体与mRNA模板分离(图9-21)。

电镜观察发现,在蛋白质生物合成的过程中,每条mRNA模板都可同时附着多个核糖体,形成一种串珠样的结构(图9-22),称为多聚核糖体。多聚核糖体的形成是由于第一个核糖体沿mRNA向下游移动后,在mRNA链上空出的起始部位又会与第二个核糖体结合,以后第三、第四个核糖体也可陆续在mRNA的起始位点进入。一般在mRNA链上每隔大约80个核苷酸就会附着一个核糖体。这种多聚核糖体的形成,大大提高了mRNA的利用率和蛋白质生物合成的速度。

图9-20 原核生物翻译延伸过程

图9-21 原核生物肽链合成的终止

图9-22 原核多聚核糖体

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