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中国对虾家系遗传多样性分析

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:由于EN0018位点,在所有家系都是单态的,因此,本研究未对其结果进行统计,认为不适合用于家系鉴别。用5个多态性微卫星引物对中国对虾5个家系进行遗传多样性分析。运用TFPGA软件进行各遗传参数分析。除1#家系以外,其他4个家系在一些微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡。根据Nei的方法对5个家系间的遗传距离和相似性指数计算,构建UPGMA图。结果表明,3#和5#家系之间的遗传距离最小,相似性最高,聚合在一起。

微卫星扩增结果显示,除了EN0018位点以外,其他5个微卫星位点都是多态的,而且在所有家系中都显示了高度的遗传变异。5个位点的多态信息含量(PIC)分别为EN0033位点0.8065,RS0683位点0.6968,RS0859位点0.7287,RS062和RS0622位点0.7414。由于EN0018位点,在所有家系都是单态的,因此,本研究未对其结果进行统计,认为不适合用于家系鉴别。

用5个多态性微卫星引物对中国对虾5个家系进行遗传多样性分析。运用TFPGA软件进行各遗传参数分析。5个位点的观测杂合度(Ho)都很高,各家系在各位点的观察杂合度在0.4.0 0.1.000 0之间。除1#家系以外,其他4个家系在一些微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡。2#和3#家系在RS0859位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡,4#家系在RS0683位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡,在EN0033位点极显著偏离。5#家系在RS0683位点、RS062和RS0622位点都极显著地偏离Hardy-Weinberg平衡。

根据Nei(1972)的方法对5个家系间的遗传距离和相似性指数计算,构建UPGMA图。结果表明,3#和5#家系之间的遗传距离最小,相似性最高,聚合在一起。1#和2#家系之间的遗传距离次之,聚合在一起,然后与4#家系聚合,最后再与3# 和5#家系相聚。

表37 中国对虾5个家系的遗传距离和相似性指数

注:对角线以上为相似性指数,对角线以下为遗传距离

图25 中国对虾5 个家系的UPGMA 图

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