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分子杂交技术用的探针

时间:2022-11-15 百科知识 版权反馈
【摘要】:近年来,基因芯片技术的快速发展和逐渐成熟,为临床细菌耐药性的快速检测带来了曙光。基因芯片又称DNA微阵列,是将大量可寻址的基因序列信息,即DNA序列有序地固定在固体介质上而成的。其基本原理是将多种探针固定于玻璃等载体上,将待测标本的DNA或RNA与探针杂交,即可获得大量信息。目前,已有应用Cy3或Cy5标记靶基因的rpoB扩增产物,然后用DNA芯片检测PCR产物,结果其检出率为85%左右。

第五节 基因芯片技术

近年来,基因芯片技术的快速发展和逐渐成熟,为临床细菌耐药性的快速检测带来了曙光。基因芯片又称DNA微阵列,是将大量可寻址的基因序列信息,即DNA序列有序地固定在固体介质上而成的。是近年来发展起来的集合了分子生物学、材料科学、信息科学、计算机技术等多种学科最新成果的尖端技术,包含了芯片制作、探针制备、杂交洗涤、荧光检测、数据采集处理和信息综合分析等步骤。其基本原理是将多种探针固定于玻璃等载体上,将待测标本的DNA或RNA与探针杂交,即可获得大量信息。大量不同的生物信息分子(如寡核苷酸、DNA或cDNA探针等)以高度密集的方式(通常每平方厘米点阵密度高400),有序地固定在固相支持物(通常为玻璃或尼龙膜等)上而形成微阵列。当荧光标记的靶分子与芯片上的探针分子相结合后,用激光共聚焦荧光扫描或电荷偶联摄像机对荧光信号的强度进行检测,从而对杂交结果进行量化分析,所以可一次性对大量样品序列进行检测和分析。

目前,已有应用Cy3或Cy5标记靶基因的rpoB扩增产物,然后用DNA芯片检测PCR产物,结果其检出率为85%左右。利用基因芯片探针杂交方法还可以对两个以上不同的耐药基因同时进行分析,如结核杆菌对INH、RFP、EMB、PZA等多种药物的耐药基因等都可同时进行检测。也可将针对耐药相关的基因的探针和进行菌种鉴定的探针固定到一张芯片上,只需一次杂交,即可获得菌株对药物的敏感性和菌种鉴定的结果。该方法灵敏、方便、特异性高、信息量大,显示了临床应用前景。然而,由于该方法目前所需实验材料和试剂成本较高,且需要昂贵的检测仪器,因而限制了其在临床实验室的推广应用。

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