的分子结构

10．3．1　SOR的分子结构

图10－12对不同来源的SOR亚基进行了氨基酸序列比较，其中，Pf代表激烈热球菌，Dg代表巨大脱硫弧菌，Tp代表苍白密螺旋体，Db代表巴氏脱硫杆菌，Dd代表脱硫弧菌，Dv代表普通脱硫弧菌。可以发现，各种SOR亚基的C－端约100个氨基酸残基有很强的保守性。

图10－12　不同来源SOR的氨基酸序列比较

其中＊、：和．分别代表氨基酸残基完全相同、仅有保守性置换和大部分属于保守性置换

按照亚基中的所含铁原子的数目，SOR可分为1Fe－SOR和2Fe－SOR。来自激烈热球菌的1Fe－SOR包括4个亚基，每个亚基有一个含铁中心，该中心的铁原子与周围的4个组氨酸咪唑基氮原子以及1个半胱氨酸巯基硫原子以配位键相连；在该1Fe－SOR的氧化型结构中有两个亚基的含铁中心Fe^3＋还与附近的谷氨酸羧基氧原子形成第六个配位键，呈八面体型六配位相互作用；而另外两个亚基，其含铁中心Fe^3＋的第六个配位体为溶剂分子。来自脱硫弧菌的2Fe－SOR含两个亚基，每个亚基有两个含铁中心。中心Ⅰ位于亚基N－端（34个氨基酸），其铁原子与邻近四个半胱氨酸的巯基硫原子形成配位键；中心Ⅱ位于亚基C－端（88个氨基酸），配位连接与1Fe－SOR的含铁中心相同。该2Fe－SOR属于双重对称分子，有两个结构域，一个由其亚基N－端的两组反平行β折叠平行靠拢，形成不完全β－桶结构，内部疏水；另一个由其亚基C－端的两组“3＋4β片层”构成，其中含有8股反平行β折叠（图10－13）。

虽然SOR的氨基酸序列与SOD无同一性，但SOR在结构上却与Cu，Zn－SOD有相似之处。如两者均含有五配位结合的金属离子含有8股反平行β折叠和天然多聚体形式存在等。这种结构的相似性可能是催化同一底物O₂的基础，见图10－12，图10－13。

图10－13　Fe－SOR的高级结构