水分在作物体内的运输包括茎叶传输和根部传输。水分在茎叶中传输在细胞内进行，有两条运行途径:①通过死细胞运行。茎叶中的导管和管胞都是中空无原生质体的长形死细胞，细胞与细胞之间有孔相连，特别是导管细胞的横壁几乎消失殆尽，对水流传输的阻力很小，适于长距离的传输。②通过活细胞运行。水分由叶脉到气孔下腔附近的叶肉细胞，均通过活细胞传输。这部分在作物体内的长度不过几毫米，但因细胞内有原生质体，加之又以渗透方式运输，所以阻力很大。
水分在根部的传输有三条并列的途径:质外体途径、共质体途径和跨细胞途径(图2－1)。质外体途径是指水分通过细胞壁、细胞间隙等没有原生质的部分移动，水分传输阻力小，传输速度快;共质体途径是水分从一个细胞的细胞质经过胞间连丝移动到另一细胞的细胞质中，移动速度慢;跨细胞途径是指水分从一个细胞移动到另一个细胞的过程，水分要两次经过质膜，主要是膜上的水通道，即水通道蛋白起重要作用。跨细胞水流的存在首先是由于膜间存在水势梯度，即渗透压差或静水压力差，流速大小取决于水势梯度的大小和膜的渗透性。但是由于技术的原因，目前无法将共质体途径和跨细胞途径区别开来，通常合称为细胞到细胞途径。尽管三种途径中究竟哪一个更重要还没有完全确定，但压力探针技术的试验表明，玉米幼苗根中质外体途径对于水分跨根皮层的运输尤为重要。
水分在根部运输所受到的阻力比在叶片运输所受的阻力大，具体原因有:①根部内皮层具有凯氏带，其细胞壁木栓化加厚，不透水，而叶片没有这种组织;②水分在根部通过活细胞原生质体运输多于在叶片中，所以输导较慢;③叶片输导系统成网状，分布在叶肉细胞之间，输导系统末端距离气孔下腔很近，只不过1到几个细胞，水分容易蒸发到气孔下腔中。
图2－1 水在根系中的运输途径
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