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启动子分析

时间:2022-02-11 百科知识 版权反馈
【摘要】:TATAbox上游的保守序列称为上游启动子元件或上游激活序列。另外,在-70~-78bp处还有一段共同序列CCAAT,称为CAAT框。没有TATA框的真核基因启动子序列中,有的富集GC,即GC框。启动子中的-10和-35序列是RNA聚合酶所结合和作用必需的顺序。但是附近其他DNA顺序也能影响启动子的功能。
启动子分析_植物发育生物学实

第二节 启动子分析

启动子是基因的一部分,控制基因转录表达的起始时间和表达程度,是RNA聚合酶特异性识别和结合的一段位于结构基因5'端上游DNA序列。

原核基因位于起点上游10bp处有一个由5个核苷酸(TATAA)组成的共同序列,以其发现者的名字命名为Pribnow框,在-35bp处也有一个共同序列(TTGACA)。在真核基因中,有一个类似Pribnow框的共同序列,即位于-25~-30bp处的TATAAAAG,也称TATA box。TATAbox上游的保守序列称为上游启动子元件(upstream promoter element,UPE)或上游激活序列(uptream activating sequence,UAS)。另外,在-70~-78bp处还有一段共同序列CCAAT,称为CAAT框(CAAT box)。在真核基因中,有少数基因没有TATA框。没有TATA框的真核基因启动子序列中,有的富集GC,即GC框。GC框位于-80~-110bp处的GCCACACCC或GGGCGGG序列。TATA框的主要作用是使转录精确起始,CAAT框和GC框主要是控制转录起始的频率。启动子中的-10和-35序列是RNA聚合酶所结合和作用必需的顺序。但是附近其他DNA顺序也能影响启动子的功能。如远隔部位的富有AT的DNA顺序能增进转录起始的频率;有些上游DNA顺序是某些能直接激活RNA聚合酶的“激活蛋白”的结合部位。

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