九、真核RNA聚合酶和它们的启动子
1.画出DEAE-Sephadex层析中真核细胞核RNA多聚酶的洗脱图谱。如果在1μg/mL的α-鹅膏素存在的条件下分析细胞核RNA多聚酶，结果如何？
2.用实验证明：聚合酶I最先位于细胞核仁中。
3.RNA聚合酶I在低离子强度下活性最高，与Mg2+作用，并且位于核仁中。由此可以推出聚合酶I的产物会怎样？
4.如何得知聚合酶I产生大的rRNA前体，聚合酶II产生mRNA前体？简述一个简单的体外转录实验，以及教材中的实验。
5.用实验证明：聚合酶III产生tRNA和5SrRNA。
6.酵母RNA聚合酶II有多少个亚基？哪个是“核心”亚基？所用三种核RNA聚合酶一般有多少亚基？
7.怎样使用表位标签法一步提取酵母聚合酶II？
8.用实验证明：聚合酶II最大的亚基与DNA结合。
9.用实验证明：聚合酶II第二大亚基中含有催化核苷酸间形成磷酸二酯键的活性位点。
10.有何证据证明：真核聚合酶II的三个最大的亚基分别与原核RNA聚合酶的βˊ、β和α亚基同源？
11.当RPB4基因被删除后，RNA聚合酶II的结构如何变化？这个缺陷型聚合酶的功能是正常还是非正常？给出证据。
12.一些制备聚合酶II的实验表明，最大的亚基(RPB1)有三种不同的形式。给出这三种形式的名称，并指出其在SDS-PAGE中的相对位置。说明原因。
13.RPB1的CTD结构是怎样的？
14.列举证明聚合酶II的RPB1对α-鹅膏素敏感(或抗性)的一系列实验。
15.简述电子和X光晶体学对酵母RNA聚合酶II及其延伸复合物的研究结果。
16.画出聚合酶II启动子草图，显示其可能包含的所有元件。
17.哪些基因倾向于含有TATA框？哪些基因倾向于不含TATA框？
18.II型转录开始于TATA框第一个碱基下游30bp处的鸟苷酸。如果删除TATA框与该鸟苷酸之间的10bp，再将该突变DNA转染细胞，转录是否依旧从该鸟苷酸开始？如果不是，从哪里开始？
19.从II型启动子中删除TATA框，最可能出现的两种结果是什么？
20.画图描述接头扫描(linker-scanning)过程。其结果可以提供什么信息？
21.列举II型启动子中的两个常见的上游元件。
22.画图描述一个典型的I型启动子。
23.I型启动子的元件是如何发现的？说出实验及结果。
24.用实验证明I型启动子元件间空间的重要性。
25.列表比较经典和非经典的III型启动子。分别给出一个具体例子。
26.简述对5SrRNA基因启动子的5’和3’端进行定位的实验及结果。
27.你认为位于基因上游的一段重复序列起增强子作用。设计实验证明假说。
28.解释：增强子活性具有组织特异性。
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