疫苗的免疫效果，可受到接种方法、接种技术、疫苗贮存、运输条件和被接种者生理状态等影响。若使疫苗能充分发挥应有的免疫作用，除掌握疫苗使用的基本原则外，还必须注意其他影响疫苗免疫效果的因素。
（一）疫苗使用方面的因素
1．免疫起始月龄 未按免疫程序规定的起始月龄接种，如在免疫起始月龄前接种，由于来自母体抗体的干扰或个体免疫系统发育不成熟，往往免疫不能成功。如对小于8个月的婴儿接种麻疹疫苗、小于3个月接种百白破混合疫苗，其免疫效果都受到一定的影响。
2．免疫接种的剂量 进入机体的抗原量必须是最适宜的，才能使机体产生最好的免疫应答。如果未按规定的剂量接种疫苗，若接种剂量过少，不能激起机体免疫反应的形成，达不到免疫的目的；若接种剂量过大，除造成疫苗不必要的浪费外，还可能加重接种反应；甚至可能产生免疫麻痹或免疫抑制，达不到预期的免疫效果。
3．接种的次数
（1）针次不足：特别是接种灭活疫苗，如百白破混合疫苗完成基础免疫必须注射3针，狂犬病疫苗完成全程免疫必须注射5针，缺少1针都会影响免疫效果。
（2）针次过多：接种针次过多，除造成疫苗浪费外，还增加了儿童的痛苦和不必要的工作量，且可增加疫苗接种反应的发生率。
（3）未能适时加强免疫：根据各种疫苗免疫持久性的观察和研究，在完成基础免疫后都要适时地进行加强免疫，以保持有效的抗体水平。如百白破混合疫苗在1.5～2周岁，脊髓灰质炎疫苗在4周岁，麻疹疫苗在7周岁时应进行加强免疫，如不进行加强免疫，待免疫力下降到一定程度，也会感染发病。
4．接种的针次间隔 各种疫苗都有规定的接种针次间隔时间，接种的针次间隔时间过短或过长，分别会影响免疫效果或防病效果。
5．操作规程 接种时没有严格执行技术操作规程，忽略疫苗本身的特性，如局部消毒的乙醇未干而接种麻疹疫苗，接种活疫苗用乙醇擦拭针头或用热开水送服脊髓灰质炎疫苗等，都有可能将疫苗病毒杀死，而影响免疫的效果。
6．疫苗的贮运 各种疫苗均应按照规定的温度贮存和运输，尤其是活疫苗对热比较敏感，因此更应严格地冷藏和冷运，否则疫苗效价下降，将直接影响免疫效果。
7．接种率 人群接种率的高低直接影响到免疫效果，接种率愈高则群体的免疫水平也愈高。有效的免疫屏障形成后，常可阻断疾病的传播。
（二）疫苗本身的因素
1．疫苗的性质 抗原的性质不同，对机体的免疫反应和形成抗体的速度及维持时间也不同。减毒活疫苗接种类似一次轻度的人工感染，不仅接种剂量小，针次少，所得到的免疫效果也较好，并能维持较长时间。
2．疫苗菌、毒种的抗原型 疫苗的型别与相应疾病的病原型别及当地流行的病原型别有关。病原型别单一，且很少发生变异的疾病，如麻疹、脊髓灰质炎等，免疫接种的效果较好，反之则差。另外，接种疫苗的型别必须与当地流行的病原型别相符，如型别不符，则免疫效果不好（有交叉免疫作用者除外）。
3．疫苗的效价和纯度 疫苗中的有效成分越多，所含其他非抗原成分越少，疫苗的效价越高，则免疫效果就好。如流行性脑脊髓膜炎多糖疫苗的效果比菌体疫苗好，其原因就在于疫苗中的有效成分纯度较高。
4．疫苗中是否含有佐剂 含有佐剂的疫苗其免疫效果均优于不含佐剂的疫苗。
（三）机体方面的因素
被接种者机体免疫功能不全或低下，或有营养不良、发育不全以及患某些传染病后，或在接种前的一定时间内，使用过免疫抑制药或免疫球蛋白被动免疫制剂等，都能影响免疫效果。
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