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趋化因子的空间结构

时间:2022-02-11 理论教育 版权反馈
【摘要】:趋化因子中不同成员在一级结构氨基酸水平上有21%~90%的同源性。图7-1 趋化因子结构示意图所有趋化因子均含有2~4个半胱氨酸的保守基序,组成特征性的两个二硫键。图7-2 趋化因子IL-8的空间构象根据趋化因子N端保守的半胱氨酸的数量及排列方式,将它们分为CXC、CC、C及CX3C4个亚类。
趋化因子的空间结构_分子医学导论

一、趋化因子的空间结构

许多趋化因子编码基因以成簇性方式定位于某特定的染色体区域(图7-1)。趋化因子中不同成员在一级结构氨基酸水平上有21%~90%的同源性。其中不同亚族成员间同源性为21%~31%,同一亚族不同成员间同源性为25%~90%。

图7-1 趋化因子结构示意图

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所有趋化因子均含有2~4个半胱氨酸的保守基序,组成特征性的两个二硫键。CXC、CC、C及CX3C的结构如图7-1所示。从目前已经清楚空间结构的趋化因子来看,各趋化因子单体有同样的高级结构:游离的N端以二硫键锚定在由3个反向平行的β片层上,C端的α螺旋则以几乎垂直于片层的方向平躺于其上(图7-2)。

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图7-2 趋化因子IL-8的空间构象

根据趋化因子N端保守的半胱氨酸的数量及排列方式,将它们分为CXC、CC、C及CX3C(C为半胱氨酸,X为任意氨基酸)4个亚类。绝大多数CXC趋化因子靠近N端的两个半胱氨酸间隔有1个任意氨基酸;CC趋化因子与靠近N端的两个半胱氨酸相毗邻;C趋化因子靠近N端处只有1个半胱氨酸;CX3C趋化因子靠近N端的两个半胱氨酸间隔有3个任意氨基酸,它的羧基端延伸了1个由胞外的黏蛋白样段、跨膜段及1个短的胞内段组成的片段。所有的趋化因子都有3个β片层(β1、β2、β3)和C端的α螺旋。

以IL-8的空间构象为例,趋化因子单体的结构一般为游离的N端以二硫键锚定在由3个反向平行的β片层上,C端的α螺旋则以几乎垂直于片层的方向平躺于其上。

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