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中国生物医学文献数据库

时间:2022-06-21 百科知识 版权反馈
【摘要】:中国生物医学文献数据库由中国医学科学院医学信息研究所开发。该数据库收录了1978年以来1 600多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录与文摘,年增长量约40万篇,学科覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学各领域。这些信息有助于正确使用主题词,并为选择更合适的主题词提供线索。分类检索既为专业学科提供系列文献,也为专业学科确定分类名和分类号提供线索。

第二节 中国生物医学文献数据库

一、数据库概况

中国生物医学文献数据库(China BioMedical Literature database,CBM)由中国医学科学院医学信息研究所开发。该数据库收录了1978年以来1 600多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录与文摘,年增长量约40万篇,学科覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学中医学及中药学等生物医学各领域。

CBM对所有收录文献按MeSH词表中译本及中国中医药信息研究所编写的“中医药学主题词表”进行主题标引,并根据“中国图书资料分类法”进行分类标引。

CBM分有光盘版CBMWin和网络版CBMWeb,本节介绍CBMWeb。

二、检索途径和检索方式

CBMWeb的检索途径有基本检索、主题检索、分类检索、期刊检索、作者检索和索引检索(图3-2-1)。

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图3-2-1 CBMWeb的基本检索页面

(一)基本检索

本系统默认的检索方式就是基本检索,用户在检索提问框输入检索词或检索式,选择是否进行“精确检索”,点击“检索”按钮执行检索。

1.字段检索 在“缺省”状态输入检索词或检索式是对中文题目、主题词、关键词、文摘、刊名、特征词这6个字段进行检索。在检索入口下拉菜单中可选的其他字段还有地址参考文献、出版年、分类号、全部(字段)等。例如:选“题目”字段,输入SARS,检索返回文献题名中出现SARS的文献(图3-2-1)。

2.二次检索 表示在上一次检索结果范围内进行搜词检索,即与上一次检索的关系为“AND”运算。具体操作是在检索提问框键入新的检索词后,点击“二次检索”。

3.命令检索 CBMWeb保留了命令检索方式,方便习惯用命令检索的用户。在检索提问框内直接输入字段标识符和检索词,例如au=王文强、中国癌症杂志in ta。

(二)主题检索

主题检索即用CBM主题词进行检索,这有助于提高文献的查全和查准。

1.检索步骤 ①点击进入“主题检索”页面。系统默认状态为在中文主题词轮排表中检索;②在“主题检索”页面输入拟用检索词,点击“查找”,系统显示含有该检索词的中文主题词轮排表;③在“主题词轮排表”中,浏览并选择主题词(图3-2-2)。“主题词轮排表”从左至右分别为款目词(主题词的同义词,不作主题标引词)、主题词、该主题词命中的文献数;④点击欲检索的主题词,屏幕显示该主题词基本信息,包括“主题词注释”和“树状结构”,选择是否“扩展检索”和“加权检索”,以及“副主题词”和“副主题词扩展检索”选项(图3-2-3),点击“主题检索”完成检索。

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图3-2-2 CBMWeb的主题词轮排索引表

另外,CBMWeb也支持用英文主题词检索。英文主题词检索的后半阶段操作与中文主题词检索相同。

2.主题词注释页面中各项目的作用和功能

(1)主题词注释:主题词注释包括主题词的中英文名称、款目词、树状结构号、相关主题词、检索回溯注释、标引注释、历史注释、主题词详解(定义)(图3-2-4)。这些信息有助于正确使用主题词,并为选择更合适的主题词(包括英文数据库检索)提供线索。

(2)主题词树状结构:在主题词注释页面的下方(图3-2-4)列出主题词的树状结构,供逐级查看其上位词和下位词,可据需要更改主题词,选择更泛指的上位词或更专指的下位词进行检索。

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图3-2-3 CBMWeb的主题词注释页面(页面上半部分)

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图3-2-4 CBMWeb的主题词注释页面(页面下半部分)

(3)主题词扩展检索:“扩展检索”指对当前主题词及其所有下位主题词进行检索,“不扩展检索”则仅限于当前主题词的检索。扩展检索为默认检索,若不进行扩展检索须选“不扩展”。例如,用主题词“肝炎,病毒性,人”进行扩展检索是对该主题词及其所有8个下位主题词进行检索,选“不扩展检索”仅对用“肝炎,病毒性,人”这个主题词标引的文献进行检索。

(4)主题词加权检索:主题词加权表示该主题词是本文论述的重点,不加权为本文的次重点。选择“加权”检索,表示要检索用主要概念主题词(即带*主题词)标引的文献,即检索时追求“少而精”;反之,系统就同时检索用主要概念主题词和次要概念的主题词标引的全部文献。CBMWeb主题检索的默认状态为非加权检索。

(5)副主题词组配检索:副主题词限定文献于主题词的某一方面。如用主题词“哮喘”并选副主题词“治疗”表示要检索哮喘各种治疗方法的文献,包括膳食疗法、药物疗法、中西医结合疗法、中医疗法、中药疗法等,因为副主题也有默认的下位扩展检索。主题词与副主题词的组配有严格的规定,不是所有的副主题词均能与任何主题词进行组配。

3.主题词检索的注意事项

(1)仔细阅读主题词注释信息的定义和历史注释,看看有否更合适的相关主题词、上位词及下位词可参与检索。

(2)通过基本检索查到文献后,在检索结果的主题词字段中若发现更合适的主题词,再用主题词到“主题检索”中重新检索。

(3)在找不到最专指词的情况下,可选择其最邻近的上位词进行检索,再从检索结果中筛选所需要的文献。

(三)分类检索

1.检索步骤 点击工具栏的“分类检索”进入分类检索页面。在检索入口中选“类名”或“分类号”,输入检索词,点击“查找”,系统显示分类表。在“分类表”中选择类名,并在分类检索页面选择“扩展检索”、“复分组配检索”,点击“分类检索”,系统返回检索结果。分类检索既为专业学科提供系列文献,也为专业学科确定分类名和分类号提供线索。如确定“生殖免疫”的分类号,可以通过分类名直接检索确定。

2.分类检索中各选项的作用

(1)扩展/不扩展检索:选“扩展检索”表示对某分类类目及其所有下位分类类目进行检索,不选“扩展检索”表示仅对当前分类类目进行检索。

(2)复分组配检索:复分组配用于对主类号某一特定方面加以限制。类目号及其类目名下列出了可与当前主类号组配的全部复分号。选择某一复分号,表示仅检索当前主类号的某一方面文献,例如,选择复分号“025”表示检索主类号的“病因学”方面文献;选择“全部复分”,表示检索与当前主类号组配及不组配复分号的所有文献;选择“无复分”,表示检索与当前主类号不组配复分号的文献。

(四)期刊检索

期刊检索供了解期刊的有关信息和查指定期刊上的文献。期刊检索的入口有“刊名”、“出版单位”、“出版地”和“期刊主题词”,例如检索入口选刊名,输入检索词“癌症”,点击“检索”,系统返回6种刊名含“癌症”的期刊列表。点击刊名,得到期刊的有关信息,继续点击“期刊检索”,得到该期刊上发表的文献。

(五)作者检索

作者检索供查指定作者发表的文献。作者检索的步骤是:点击进入“作者检索”页面,输入作者姓名,点击“查找”,在作者列表中点击所要查找的作者姓名,或点击右侧的人头图像检索作为第一作者发表的文献。

这里的作者检索与基本检索中的命令检索“AU=作者姓名”的检索结果相同,都属精确检索。若用命令检索“作者姓名in AU”形式,则为模糊检索。检索单名作者时用模糊检索容易造成误检,例如,输入黄春in AU,会检索出作者为黄春、黄春红、黄春林等大量文献。

(六)索引检索

点击进入索引检索页面,输入检索词后点击“查找”,系统返回输入词所在的索引词表片断。浏览选中需要的索引词,点击“检索”,系统返回检索结果。

索引词表中的索引条目来源于题目、文摘、关键词、主题词、刊名等默认字段,而索引词列表中显示的命中文献数为所有字段的检出结果数,故某索引词的检出文献数与索引词列表中显示的命中文献数有时不一致。“索引检索”往往在对拟定输入的检索词无把握时采用。

(七)辅助检索

辅助检索主要有限定检索、定题检索、检索史3个选项。

1.限定检索 在基本检索界面进行限定设置的步骤是:点击“限定检索”,选择限定检索框内的时间段、文献类型、年龄段等选项,点击“确认”,“检索设置”按钮前出现勾选符号,表示检索限定已设置。在取消限定检索前,限定设置对以后的检索始终有效。限定检索中的选项划分为若干组,每组内的关系为“OR”,组间关系为“AND”。

2.定题检索 定题检索供定制和跟踪某一课题的最新文献。登录定题检索后,先前已经保存的检索策略名称会显示在页面下方。点击选中的检索策略名称,可以浏览其对应的检索式集合。可选择一个或多个检索策略文件进行重新检索、最新文献检索或删除该检索策略。

3.检索史 检索史界面按时间顺序依次显示已做过的检索式,从中可选择一个或多个检索式用布尔算符AND、OR、NOT进行组配检索。利用检索史检索可简化键盘的操作。

三、检索结果的处理

(一)检索结果的显示

检索结果的显示有题录、文摘和详细3种格式(图3-2-5),选择其中之一,点击“显示”。也可用鼠标标记需要显示的记录,再点击显示按钮,屏幕只显示选定的记录。

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图3-2-5 CBMWeb记录显示页面

从2004年起,CBMWeb与“中文科技期刊数据库”(维普全文数据库)之间实现了全文链接,点击记录右侧的全文获取图标,可直接获得全文。对于CBMWeb收录而“中文科技期刊数据库”不收录的期刊无法直接读到全文。

(二)检索结果的输出

在“文本显示”状态下点击“输出”按钮,即以文本格式输出命中记录或标记记录到屏幕,可再通过浏览器中的有关功能进行保存或打印。在输出下拉菜单中选“文件保存”,点击“输出”按钮,系统按指定的路径和文件名保存记录。

四、检索举例与分析

【例1】 检索2002年以来中医药治疗急性肝炎的文献。

在基本检索的“缺省”状态下分别输入以下检索式,限定检索中的年代范围选2002—2008,得到以下检索结果:

#1 2 急性肝炎 AND 中医药治疗

#2 8 急性肝炎 AND 中医药 AND 治疗

#3 96 急性 AND 肝炎 中医药 AND 治疗

#4 336 急性 AND 肝炎 AND (中医 OR 中药 OR 中医药) AND 治疗

可见,以上第4个检索式检出的文献最全。其他3个检索式漏检文献的原因有:①先组式检索词“急性肝炎”与出现“急性黄疸性肝炎”和“急性乙型肝炎”等文献不匹配,而用后组式的“急性 AND 肝炎”能检索命中;②检索词“中医药治疗”和检索式“中医药 AND治疗”与“中药×××治疗×××”的文献不匹配,而用“(中医 OR 中药 OR 中医药)

AND 治疗”能检索命中。第4个检索式虽然查得最全,但也可能有部分误检,如检索到的文献中出现“民间常用岩黄莲治疗急性腹痛、火眼白翳及肝炎等”,其中提及的肝炎并非一定是急性肝炎。

【例2】 检索《中华内科杂志》上有关消化系统肿瘤的文献。

在基本检索页面上的检索入口选“刊名”,输入中华内科杂志,点击“检索”得到9776篇。检索字段改为“缺省”,输入消化系统肿瘤,点击“二次检索”,得到7篇。检索结果之少明显提示有漏检,漏检的主要原因是许多相关文献中只出现胃癌、肝癌、肠癌等具体的肿瘤名称,而不出现“消化系统肿瘤”这个上位词。遇此情况,可利用“分类检索”中的扩展检索解决。在“分类检索”的“分类导航”中逐级选到“R735消化系肿瘤”,然后选“扩展检索”和“全部复分”,点击“分类检索”,得到162253篇消化系统肿瘤方面的文献,再与“中华内科杂志”检索结果进行“逻辑与”组配,得到390多条文献。本例的检索历史概括如下:

#1 9776  刊名=“中华内科杂志”

#2 4381  消化系统肿瘤

#3 162253 分类号=“R735/扩展/全部复分”

#4 7    #1 AND #2

#5 396   #1 AND #3

习题

1.检索冠状动脉疾病死亡率的文献。

2.用主题途径检索急性巨核细胞白血病治疗的文献。

3.检索程晓东撰写的有关风湿性关节炎方面的文献。

4.用“索引检索”途径检索发表在《实用内科杂志》上有关2型糖尿病方面的文献。

5.用分类途径检索胆囊炎超声诊断的文献。

(蒋佳文)

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