蛋白质分子的物理结构

三、蛋白质分子的物理结构

练习题

1.(a)哪些氨基酸是极性的？哪些是非极性的？

(b)异亮氨酸的非极性是否比丙氨酸弱？为什么？

2.多肽链主链上的什么键不能自由旋转？

3.说出下列氨基酸参与形成蛋白质侧链的键的名字：半胱氨酸、精氨酸、缬氨酸、天冬氨酸。

4.你能推测在内部环境中谷氨酸盐和赖氨酸所处的环境分别是什么样的吗？

5.下列各组氨基酸，哪一组可能在蛋白质中形成簇？(a)Asn，Gly，Lys；(b)Met，Asp，His；(c)Phe，Val，Ile；(d)Ala，Arg，Pro.

6.一个酶，其活性位点的15个氨基酸残基是已知的，你预测它们在蛋白质一级结构中的相对位置在哪里？

7.什么是蛋白质的一级结构、二级结构和三级结构？

8.一个蛋白含有很长的α螺旋或β折叠的结构域，那么它可能形成怎样的三级结构？如果含有很多短的α螺旋或β折叠的结构域呢？

9.什么是诱导契合？它如何促进催化反应的进行？

问答题

1.说出下列多肽能否形成由多个相同亚基组成的蛋白质，并给出理由。

(a)折叠的多肽含有独特的表面区域，形状互补，并且此区域附近没有极性氨基酸

(b)一个大的疏水簇在表面下的一个缝隙内

(c)蛋白质有很大一个疏水簇，在两个赖氨酸之间

(d)表面含有一段区域，里面带正电荷和带负电荷的氨基酸呈线性交替分布

2.酶是否可能具有刚性结构，为什么？

3.一般情况下，双倍体细胞含有“+”、“－”等位基因编码酶E，表型为E⁺。假如分离出了一种特殊的突变体，表型为E^－，但“+”等位基因是存在的，请对这一现象给出合理的解释。

4.许多蛋白质由几个相同的亚基组成，这些蛋白质中，有些只有一个结合位点，有些含有几个相同的结合位点，你能预测两种情况下结合位点的位置在哪里？

5.假如清楚酶或结合蛋白的活性位点在结合前和结合后的精确结构，怎样判断该位点在结合底物时是锁钥模型还是诱导契合模型？说明理由。

概念题(思考题)

1.酶活性位点的各种氨基酸侧链(功能基团)怎样协助酶结合并催化底物？

2.酶催化的反应非常迅速，可以把反应速度提高10¹⁵倍。在实验室里，为了研究一个酶的活性机制，需要把反应速度降下来，请给出可能的办法。

3.一个典型的细胞通常有1000～2000种化学反应是酶催化的，为什么这些反应都需要有自身专门的酶来完成？