在传统的西方经济理论中，政府被定位为市场的“守夜人”，担负着维护市场交易秩序、提供基本制度保障的责任。在我国战略性新兴产业的发展中，由于我国市场发展阶段的特殊性，使得政府在市场运行中所扮演的角色虽不同于西方理论的定位，但也是必要存在的。如由于我国计划体制时期较长，导致我国现在的行业发展中仍然存在着大量的体制性障碍和所有制歧视现象。民营企业在进入新兴产业过程中普遍会遇到市场准入的“玻璃门”，并且由于金融制度的不完善，银行贷款往往存在所有制歧视，造成中小企业的融资困难等问题。因此战略性新兴产业发展中政府责任就是通过制度供给，打破行政性行业垄断，维护市场公平竞争环境。此外，政府还有义务加强基础设施建设，为战略性新兴产业的发展提供优良的物质环境。
虽然国家发改委于2011年出台了《关于鼓励和引导民营企业发展战略性新兴产业的实施意见》，要求清理和规范针对民营资本的产业准入条件。但是由于战略性新兴产业涉及的电信和节能环保等部门属于行政性垄断领域，一时很难打破行政性进入壁垒。此外，就战略性新兴产业发展支持政策本身而言，也存在着注意力集中于大型央企和重点项目，忽视对配套产业、民营企业和广大中小企业的支持，客观上也加剧了竞争环境的不公。
政府对战略性新兴产业作用机制如图5-4所示。
图5-4 战略性新兴产业发展中的政府作用机制
政府政策作用机制的缺陷总结起来包括：政府作用存在着越位、缺位和错位三方面的问题。由于制度惯性问题，我国政府与市场关系一直存在着边界不清，职责不明的问题，导致产业发展中政府干预容易干扰到企业的正常经营决策，反而造成企业和产业效率低下，政府作用走到了政策初衷的反面；而在技术标准、技术路径的选择等产业发展的制度缺口政府却往往不能及时提供，造成产业发展迟滞；而已有的政策体系中还存在着支持力度不足，政策效果不显著的现象。
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