美国著名音乐治疗家惠勒和亚罗姆（1983）及伍尔柏格（1967）根据以前的心理治疗分类体系、临床实践和研究，将音乐治疗的临床应用分为三个层次。我们可以根据治疗的需要和方法的适应性，将各种音乐治疗治疗方法技术归纳到这些不同的层次中。
支持性、活动取向的音乐治疗（supportive，activities-oriented music therapy） 在这一层次，治疗的目标一般是通过各种治疗性的音乐活动，而不是通过内省或对心理的分析来达到的。支持性音乐治疗活动的目的是提供病人参与和体验治疗过程的机会，强化病人健康的行为。内省、思考和语言的心理分析等方法的使用在治疗时间上仅占一个很小的部分，治疗的重点集中在对“此时此地”的体验和可观察的行为上。活动的目标是增强正常的心理防御机制，促进正确的行为控制能力，支持健康的情感和思想，打破社会性孤立状态，提供安全感和现实社会的信息刺激，把病人置于集体的动力影响之下，并对紧张焦虑的病人起到安抚作用。治疗性的音乐活动是有严格计划组织的干预过程，目的是为病人提供情感上的支持，提供体验成功感的机会，以及缓解焦虑等其他有益的作用。在音乐活动的过程中，治疗师对病人进行指导、支持，并提供安慰和建议。不同程度的病人，从自我人格基本完整，仅仅是在紧张状态下暂时产生心理障碍的正常人，到有精神创伤、心理严重退行，或产生幻觉幻想的急慢性精神病患者，以及有器质性和情绪性症状，或有严重恐惧和焦虑的病人都可以从这一层次的音乐治疗中获益。
惠勒指出这一层次的音乐治疗有如下特点：
1．达到治疗目标的途径是通过活动的体验，而不是通过语言的内省。
2．为了发展适应性行为，需要对情绪和冲动进行抑制。
3．治疗的焦点放在行为上，而不是隐蔽的内部过程或因果关系上。
4．利用病人的积极资源。
5．治疗师在治疗中充当积极的、高度指导性的领导角色。
6．在治疗过程中很少需要治疗师本人对自己的情感进行内省。
再教育、内省和过程取向的音乐治疗（reeducative，insight and process-oriented music therapy） 在这一层次音乐治疗的过程中，音乐活动伴随着治疗师与病人之间的语言交流，而且语言交流越来越成为重要的组成部分。在治疗过程中，音乐活动的内容主要针对情感和思想观念来安排，并成为语言讨论过程的主题。治疗强调暴露个人的思想、情感和人际间反应方面的问题。治疗的重点集中在对“此时此地”的体验，以及治疗师与患者之间的人际反应过程。在这一层次的治疗中，病人的心理防御机制和不正常的人际行为都可能受到挑战，而治疗的目的是建立和促进正确的行为模式。
因此治疗活动的设计是强调对情感的认知、创造性地解决面临的问题，以及促使不良行为改变。但是在这一层次的治疗中并不进行对潜意识矛盾的探索。与前述支持层次相比，治疗仍然要求病人把主要精力放在自我暴露上，并主动地提高通过内省来理解自己行为的能力。认知层次的音乐治疗体验侧重于帮助病人重新建立自己的价值体系和行为模式，学习新的人际态度和责任感。
惠勒强调在这一层次的音乐治疗中，治疗对象通过学习新的问题解决方法来达到更高的适应性功能水平。
重建、分析和宣泄取向的音乐治疗（reconstructive，analytically and catharsis-oriented music therapy） 从20世纪70年代中期以来，人们逐渐注意到音乐治疗在深层心理治疗中的巨大潜力和价值，越来越多的音乐治疗师开始意识到音乐与人类潜意识活动的密切联系。音乐与潜意识活动有一个显著的共同特点，即非语言性。音乐与潜意识从本质来说都是无法用语言来描述的，正所谓“只可意会不可言传”。但它们都对人的情绪心理有巨大影响。
在这一层次，音乐治疗活动被用于发现、释放和解决那些对个人的人格发展产生消极影响的潜意识矛盾。心理学认为，人的适应性行为不是建立在思想意识之上，而是由潜意识心理活动引发的，如生活与现实中矛盾所产生的压抑等等。在这一层次的治疗中，音乐治疗活动常常被用来引发联想，以及与现在或过去经历有关的情感，患者的潜意识内容被用来重建新的心理防御机制，深化自我理解，促进自我的冲动控制能力，以及更加成熟的本能动机和内驱力，进而达到重建人格的目的。
这一层次与认知行为层次的区别在于要求病人内省的程度和质量不同，并集中在病人的过去经历（精神分析取向）或人格内部的结构或矛盾冲突（存在主义、格式塔主义取向）。心理分析和宣泄层次的治疗目的是引发对关键的潜意识矛盾的领悟，并通过在内省中对最深层的恐惧和矛盾的领悟，促使人格转变。心理分析层次的治疗通常针对心身疾病、抑郁症、人格障碍和神经症的行为症状。
这一层次要求治疗师必须接受过高级水平的训练和督导。参与这一层次治疗的病人通常是要向自己的现有人格结构进行挑战的，必须能够，并有足够的治疗动机参与这种通常为长程的治疗。
惠勒和伍尔柏格的音乐治疗干预层次理论在当时主要是针对精神病人的心理治疗而提出的，但是对于其他人群和治疗领域也有很好的借鉴和参考作用。
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