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回文结构的获得

时间:2022-02-14 理论教育 版权反馈
【摘要】:在后续的内容中,我们将讨论核酸序列回文结构的分布,回文GC含量,回文密度等特征,以及它们在蛋白质折叠过程中的作用与影响。本章分析了几种病毒核酸序列的回文结构分布,并基于几种病毒蛋白质中的氨基酸片段,探讨回文结构对蛋白质折叠的影响,希望对病毒的结构特征再增加一些了解。

在后续的内容中,我们将讨论核酸序列回文结构的分布,回文GC含量,回文密度等特征,以及它们在蛋白质折叠过程中的作用与影响。所以,首先有必要计算出每个回文结构的位置及其特征。根据回文结构的定义,我们计算了样本核酸序列中所有不同长度的广义回文结构及每一个回文结构在序列中的位置。考虑到长回文结构更有利于茎环结构的形成,从而更有可能影响蛋白质的结构和功能,所以在我们的统计中,只考虑茎长度大于或等于4nt的回文结构,之后,计算出每一回文结构的特征参量。

病毒是生命的最简单组织形式,简单的病毒主要由蛋白质和核酸两类生物大分子组成,但是病毒遗传信息的组织、表达和调控以及在宿主细胞内的装配和复制,遵循着一般生命现象的规律,所以它们成为研究蛋白质、核酸结构和功能及它们之间关系的一个十分有用的模型。近年来,艾滋病、非典(SARS)、禽流感、甲型H1N1流感等病毒性传染病的发生和流行,使人们生存面临新的威胁。因此对病毒机理及防治等方面的研究就显得更加重要和紧迫。为此,人们正从不同的方向努力来了解各种病毒入侵宿主细胞、转录、翻译、蛋白质的加工成熟、复制、装配及出芽等过程。本章分析了几种病毒核酸序列的回文结构分布,并基于几种病毒蛋白质中的氨基酸片段,探讨回文结构对蛋白质折叠的影响,希望对病毒的结构特征再增加一些了解。

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