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蟹类微卫星的特征

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:依据Weber提出的微卫星序列分类标准,可以把微卫星序列划分为完美型、不完美型和复合型3类。完美型的微卫星是指没有中断的重复序列;不完美型的微卫星指具有1个或多个中断的重复序列;复合型的微卫星则指不同种重复序列被3个以下的非重复碱基间隔。在邓杰内斯蟹的99个含有侧翼的微卫星序列中,19个为完美型,48个是不完美型,32个是复合型。这些重复序列中,60%为完美型,15%为非完美型,余下的25%为复合型。

依据Weber(1990)提出的微卫星序列分类标准,可以把微卫星序列划分为完美型(perfect)、不完美型(imperfect)和复合型(compound)3类。完美型的微卫星是指没有中断的重复序列;不完美型的微卫星指具有1个或多个中断的重复序列;复合型的微卫星则指不同种重复序列被3个以下的非重复碱基间隔。在邓杰内斯蟹的99个含有侧翼的微卫星序列中,19个为完美型,48个是不完美型,32个是复合型。在美洲蓝蟹中,通过二核苷酸筛选,在18个含有重复序列的克隆中,78%的序列片段含有二核苷酸重复,其中大部分能与筛选用的(AC)17探针匹配。2个克隆含有四核苷酸重复序列,3个克隆含有复合重复序列。其中,72%为完美型,11.1%为非完美型,16.7%为复合型。重复单位数范围为7到61(Steven,et al,2005)。通过混合的四核苷酸重复序列探针进行筛选,在20个含有重复序列的克隆中,9个含有简单的二核苷酸重复,5个包含四核苷酸重复,1个含有五核苷酸重复,另外5个包含有复合重复序列。这些重复序列中,60%为完美型,15%为非完美型,余下的25%为复合型。重复单元数目范围为3 ~ 49。

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