遗传图谱的用途

1）基因定位与QTL分析

一张较为饱和的遗传图谱有利于快速将质量性状基因定位，从而可以在该基因两侧获得与其连锁的分子标记。遗传图谱构建的另一个重要方面就是将数量性状分解成多个QTL，将这些QTL定位到染色体的精确位点，并计算每一QTL对表型的贡献率以及各个相对QTL间的相互作用方式及不同QTL之间的互助关系。近年来主要对农作物的育性、抗性、生长发育、产量及其构成因素和品质等进行了研究，在有关的染色体连锁群上找到了相应的QTL位点。

2）比较基因组研究

比较基因组研究主要是利用相同的DNA分子标记在相关物种之间进行遗传或物理作图，比较这些标记在不同物种基因组中的分布特点，揭示染色体或染色体片段上的基因及其排列顺序的相同（共线性）或相似性（同线性），并由此对相关物种的基因组结构和起源进化进行分析。

3）基于遗传图谱的基因克隆

克隆基因是分子遗传图谱构建最重要的应用之一。基于遗传图谱的基因克隆也叫定位克隆（positional cloning），又称图位克隆（map-based cloning）。随着高密度遗传图谱和物理图谱的构建，定位和克隆已成为可能。其过程为首先利用分子遗传图谱，在目标基因的侧翼得到连锁非常紧密的标记；然后由这些标记去筛选大片段DNA文库，鉴定出与标记有关的克隆，继之以亚克隆和染色体步移（chromosome walking）获得含有目的基因的克隆片段，最终再辅之以转化和互补测验加以验证。近年来，运用基于图谱的克隆技术已分离到了大量的植物基因，尤其是与抗病有关的基因。

4）标记辅助选择（MAS）

MAS就是通过对与目标性状（基因）紧密连锁的分子标记的检测达到对目标性状的控制。而传统的选择主要是依靠肉眼观测表型性状，这对于受环境条件影响较大的性状则选择效率很低，对于抗病性等质量性状的选择则需采用特殊的接种方法才能鉴定筛选，而生理生化等性状的选择程序则更为复杂。