一、COE计划的后续展开
由于COE项目实施对日本创建世界一流大学起了积极推动的作用，因此在COE项目于2007年全面结束之际，文部科学省再次拨款设置“全球COE项目”，继续推进日本大学建设高水平科学研究基地。
全球COE从2007年开始立项，主要根据COE时期的科研业绩进行审核认定。至2009年总共在8个领域立项140项，其中交叉科学24项，医学、数理科学、机械土木科学及社会科学等4个领域各14项，生命科学、化学及材料科学和电子信息科学等3个领域各13项，人文科学12项。与COE时期相比，立项数大幅减少，但每个项目投入的经费根据学科特点从5千万日元至5亿日元不等，与COE时期相比，几乎增加一倍以上，显示日本政府对建设高水平教学科研基地，促进大学竞争力的决心进一步增强。
表4-4 大学“全球COE”立项状况
资料来源：週刊ダイヤモンド.COE獲得額，2010－2－27
二、21世纪COE计划的补充：特色大学教育支援计划
由于COE的资助原则与基准是面向科研活动的，因此其结果对重点研究型大学有利，不利于科研实力薄弱而教学实力相对较强的私立大学及公立大学。为了弥补COE计划的不足，也为了减少私立及公立大学的不满，文部科学省于2003年推出了特色大学教育支援计划。该计划以创建个性化大学、提高大学教学质量、强化大学国际竞争力为主要目的，奖励并资助教学富有特色的大学学科及专业。
根据特色大学教育支援计划的规定，所有的大学包括短期大学均具备申请资格，可以以整个大学为单位，也可以以下属的学科及专业为单位进行申报。具体的审核事务由文部科学省委托以大学基准协会为主成立的特别委员会负责。
各大学包括短期大学及其所属的学科及专业点根据特色大学支援计划所规定的五大方向，结合本学科与专业的特色进行申报。五大方向分别是：综合类、课程类、教学方法类、学生的学习生活等方面的支援类以及社会服务类等。
特色大学教育支援计划的审核基准主要分理念、特点、组织性、有效性以及发展性等五部分。
理念部分主要审核申报单位具体的教学目标与其大学的教育理念是否一致，实现教学目标的方法、计划是否合理。
特点部分主要审核教学方法以及内容方面是否有创意，是否具有普遍意义能为其他大学提供借鉴，以及是否注重学生的个性发展和人性培养。
组织性部分主要审核教职员对该学科特色的理解以及运用程度、大学的支援体制等。
有效性部分主要审核对教育特色所产生的效果，以及教学评估方法与改善机制是否合理。
发展性部分主要审核学科与学科特色的发展后劲。
从审核基准看，特色大学教育支援计划对学科与专业更多关注的是教学的特色与发展后劲，而不是像COE那样，更多关注的是与世界最高科研水平的比较。
在审核程序方面，特色大学教育支援计划基本参照了21世纪COE计划，其组织机制由总委员会、综合审查部以及五个大类审查部组成。每个大类审查部各有20到30名审查员，由学术界以及社会各界的权威人士担任，负责各大类特色学科的审核工作。综合审查部由各大类审查部的部长及代表组成，负责协调各个专业领域研究点的审核工作，以确保总体的平衡以及重点领域的突出。总委员会由学界、企业界等领域的30位著名人士组成，负责确定审核评议的方法和审核基准，审核并公布最终结果。
由于具体的申请及审批程序类似21世纪COE计划，所以特色大学教育支援计划又被称为教学版的COE计划。
特色大学教育支援计划从2003年度开始实施，至2005年度共设立特色学科185个，其中2003年度设立80个，2004年度设立58个，2005年度设立47个（文部科学省．特色ある大学支援プログラム［EB/OL］.
http://www.mext.go.jp/a-menu/koutou/kaikoku/gp/003.html.）
从表4-5可以看出，在受资助的绝对数量方面，私立大学远远超出了国立和公立大学的总和，不过这主要是由于私立大学总数庞大，申请基数高。在采用率方面，国立大学的比率虽然每年有所递减，但仍然相当于公立或私立大学的2倍左右。当然，与21世纪COE计划相比，国立大学与公立、私立大学在经费分配数额方面的差距大大缩小。
特色大学教育支援计划的经费资助原则上规定为2到4年，2005年度的总资助金额为33亿日元。根据文部科学省的规定，每个受资助项目的最高金额不超过2400万日元，其中文部科学省的拨款最多不超过1550万日元，其余不足部分由大学自行解决。总之，与21世纪COE计划对大学高水平研究基地的大力扶持相比，特色大学教育支援计划对大学教学质量提高方面的资助是非常有限的。不过文部科学省今后的方针是加大对大学教学质量提高方面的投资。从2005年开始，文部科学省参照21世纪COE计划及特色大学教育支援计划的模式，新设“魅力大学研究生教育支援计划”，投资40亿日元，改善大学博士研究生教学，促进大学高层次人才的培养。
表4-5 各类院校特色大学教育支援计划申请及采用状况
注：采用率=采用数÷申请数×100%；“其他”表示国立、公立、私立院校共同申请的项目
资料来源：文部科学省.特色ある大学支援プログラム
世界一流大学建设是日本为全面推进高等教育改革，强化科学研究水平而实施的一项重要战略。在整个战略实施过程中，日本政府采取了稳扎稳打、有序推进的策略。首先是通过研究生院重点化政策的实施调整大学结构功能，确立了研究生教育及科研主导大学发展的趋势，为全面推进世界一流大学建设创造了良好的环境氛围。随后在具体实施21世纪COE计划时充分借鉴与运用了20世纪90年代COE计划的经验，甚至直接沿袭其名（尽管对象、内容完全不同），有效避免了潜在的反对意见，使计划得以顺利出台。而在计划按预定的5年规划顺利收尾之际，顺势推出了新一轮的后续项目，保证了世界一流大学建设战略得以持续推进。
从日本实施世界一流大学战略的10余年过程看，它对提升日本一流大学学科建设水平，增强基础研究领域的科研实力等均产生了明显的效果。进入21世纪，日本大学在材料科学、生命科学等前沿领域相继取得了突破性进展。从2000年至2012年，已有10名日本学者在物理、化学及生命科学领域先后获得诺贝尔奖，超过了此前半个世纪日本获诺贝尔奖人数的总和。这些成就充分说明了世界一流大学建设战略对推动日本高等教育及科学研究发展的意义与价值。
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