借鉴熊斌等学者 (2002) 对生命系统语义模型的相关研究，根据生命系统的层次包含关系，我们首先可以得到生命系统模型ML的层次包含关系:
但是，层次包含关系并不能反映生命系统的各个子系统间物质/能量及信息的交换、处理情况，不能反映生命系统的动态变化特征，因此，生命系统语义模型还应该表示出生命系统各子系统之间的关系，记为R(X)，其中X是系统变量的集合，那么生命系统的语义模型可以表示为如下的形式:
上式中，Xi= {Xi1、Xi2、…} 是组成子系统
所有变量的集合。
这样我们可以将生命系统语义模型用来对农业合作经济组织结构进行形式化描述。
一、超国家系统层、社会层、社区层
(一) 国际农业组织层 (VE)
VE={VGii=1、2、…、n1}
上式中，VE是基于国家层次的农业组织机构更上一层的国际农业组织机构，它表示为由n1个国家农业组织机构(VGi) 的集合，Xi为组成国家农业组织机构所有系统变量的集合，
表示各国家农业组织机构组成国际农业组织机构的方式，它反映了各国家农业组织机构之间进行物质/能量及信息交换、处理的特点。
(二) 国家农业组织机构层 (VG)
VGi={TEjj=1、2、…、n2}，r=1、2、…、n1; TEj∈Ek(k=1、2、…、m)
上式中，Ek表示参与国家农业组织机构的各地区农业合作经济组织的集合，国家农业组织机构 (VGi) 表示为由属于不同地区的n2个农业合作经济组织 (TEj) 组成的集合，Xj为组成农业合作经济组织的所有系统变量的集合， 
表示来自不同地区的农业合作经济组织组成国家农业组织机构的方式，它反映了各农业合作经济组织之间进行物质/能量及信息交换、处理的特点。
二、组织层 (农业合作经济组织层: TE)
TEi={BBjj=1、2、…、n3}，i=1、2、…、n2
上式中，农业合作经济组织 (TEi) 表示为n3个职能部门 (BBj) 的集合， Xj为组成职能部门的所有系统变量的集合，
为合作组织内的各个职能部门组成合作组织的方式，它反映了各职能部门之间进行物质/能量及信息交换、处理的特点。
三、群体层 (职能部门层: BB)
上式中，职能部门 (BBj) 是由满足一定功能要求的员工 (WRj)、设备(MEl) 以及资源(REm) 组合而成的集合，Xjlm为由各职能部门员工、设备及资源所决定的所有系统变量的集合，
表示各职能部门内的员工与一定的设备、资源进行组合，组成各职能部门的方式，它反映了人、设备、资源之间进行物质/能量及信息交换、处理并协同工作的特点 (熊斌等，2002)。
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