【摘要】：经典的遗传标记仅能检测到少数数量性状基因座位与遗传标记之间的关联，无法对整个基因组进行分析，MAS则直接基于DNA水平，大大加快了回交育种的进程。利用MAS必须具备两个重要的条件：一是与目标基因紧密连锁的分子标记。由于分子标记辅助选择研究的对象是大规模的育种群体，因而要求检测过程简单、成本低、自动化程度高。目前的遗传图谱主要是以RFLP为标记绘制的，在育种中不易应用，应将其转为以PCR为基础的标记。
大多数重要经济性状如产量、品质、抗逆性等表现为数量性状的遗传特点，数量性状的表达受生物体内部遗传背景、发育阶段及外界环境条件的影响。因此，仅仅根据表型无法区别遗传因子和环境条件对性状表达的影响，而且育种周期长，选择效率也不高。为提高选择效率，必须在数量性状和可作为选择指标的分子标记之间建立起关联和连锁关系。经典的遗传标记仅能检测到少数数量性状基因座位与遗传标记之间的关联，无法对整个基因组进行分析，MAS则直接基于DNA水平，大大加快了回交育种的进程。
利用MAS必须具备两个重要的条件：一是与目标基因紧密连锁的分子标记。标记基因座位与目标基因座位之间的遗传距离决定了分子标记辅助选择的准确率，遗传距离越小准确率越高。二是检测手段高效、准确、低成本和自动化。由于分子标记辅助选择研究的对象是大规模的育种群体，因而要求检测过程简单、成本低、自动化程度高。目前的遗传图谱主要是以RFLP为标记绘制的，在育种中不易应用，应将其转为以PCR为基础的标记。在遗传标记的自动化方面也有较大进展，点杂交技术、位点特异扩增技术（allele-specific amplification）、DNA芯片（chip）自动化技术等均有利于分子标记辅助育种。
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