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基于单核苷酸多态性的标记

时间:2022-10-06 百科知识 版权反馈
【摘要】:SNP标记是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。与其他分子标记相比,SNP具有分布密度高、遗传稳定等优点,再加上先进的高通量SNP检测技术的成熟发展,SNP标记在生物科学领域应用十分广泛。

此类技术是基于DNA序列中因单个碱基的变异而引起的遗传多态性。其中,插入缺失长度多态性(insertion and deletion length polymorphism,In Del)标记和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记是基于基因组重测序技术而发展起来的第3代新型分子标记,在生物技术领域正发挥着越来越重要的作用。

SNP标记是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。这种变异包括单个碱基的缺失或插入,更常见的是单个核苷酸的替换。与其他分子标记相比,SNP具有分布密度高、遗传稳定等优点,再加上先进的高通量SNP检测技术的成熟发展,SNP标记在生物科学领域应用十分广泛。然而,高通量SNP检测技术,并非任何时候都适用,因此需要不同的SNP分型方法对其进行检测。用于检测SNP的方法有很多,根据原理的不同可分为5种类型:一是直接进行测序;二是基于PCR以及酶切方法;三是DNA构象的不同;四是杂交方法;五是根据熔解曲线形状不同检测SNP位点。

In Del标记是指在基因组水平上由一定数量核苷酸的插入或缺失所引起的DNA序列的多态性。根据基因组中插入缺失位点设计能够扩增这些插入缺失位点的特异性引物,PCR产物利用电泳技术就可以得到其长度的多态性,该标记具有共显性,操作简便,稳定性好等特点,是一种较理想的分子标记类型。

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