《基因论》问世和摩尔根遗传学派的建立

摩尔根非常强调实验的重要性，强调理论思考必须以实验事实为依据，反对超出实验事实可以检验的范围而作无根据的推测，他曾戏言自己是实验室中的一条虫。同时他也很重视理论思考，反对仅仅描述实验结果。他还经常对已有的成果进行系统地总结，形成比较完整的理论认识发表出来。

1915年，摩尔根和助手布里奇斯、斯特蒂文特（A.H.Sturtevant，1891—1971）、缪勒（H.J.Muller，1890—1967）合著的《孟德尔式遗传的机制》出版。此书是他们几年来以果蝇为主要实验材料的遗传学研究的总结，阐述了伴性遗传、基因连锁与交换、基因在染色体上直线排列等重要问题。染色体遗传学说即基因论的主要观点，在这部书中都已经提出来了。此书出版后极受重视，被认为是新的、科学的遗传学的入门书。摩尔根实验室的研究方法，被认为是遗传学研究的楷模。摩尔根实验室被看做遗传学研究的圣地，很多人慕名前来求学和求教。经典遗传学的主流学派——摩尔根学派，或叫孟德尔摩尔根学派，开始逐渐形成和壮大。我国的著名遗传学家李汝祺、谈家桢，都是摩尔根实验室培养出来的博士。《基因论》中文本译者卢惠霖，也曾在摩尔根实验室学习过。

1925年出版的《遗传学文献》第二卷第一期，是摩尔根及其助手历年来在多家刊物上发表的论文专集。有人说此书如同遗传学界的《圣经》，有志于遗传学的研究人员非读不可。

1926年，摩尔根的《基因论》一书出版。此书总结了摩尔根以及助手们的研究成果，是自孟德尔定律提出以来遗传学研究的系统总结，用基因理论对当时已经发现的几乎所有重要遗传成果作出了阐述，标志着基因论的成熟，是经典遗传学最重要的理论著作。1928年，《基因论》又出了增订与修正版。中文版的《基因论》，就是由这个增订与修正版译出。卢惠霖先生1949年就完成了此书的翻译工作，但由于多种原因直到1959年才得以出版。

《基因论》第1章第6节“基因论”中说：“基因论认为个体上的种种性状都起源于生殖质内的成对的要素（基因），这些基因互相联合，组成一定数目的连锁群；认为生殖细胞成熟时，每一对的两个基因依孟德尔第一定律而彼此分离，于是每个生殖细胞只含一组基因；认为不同连锁群内的基因依孟德尔第二定律而自由组合；认为两个相对连锁群之间有时也发生有秩序的交换；并且认为交换频率证明了每个连锁群内诸要素的直线排列，也证明了诸要素的相对位置。”这是基因论的最权威表述。