微生物数码分类鉴定的基本原理

一、微生物数码分类鉴定的基本原理　

微生物鉴定系统的生化反应主要包括鉴定细菌对碳水化合物(多种糖或醇)、氨基酸(赖氨酸、鸟氨酸、精氨酸等)、蛋白质(靛基质试验、硫化氢利用等试验)、无机盐类(硝酸盐还原试验、枸橼酸盐试验、丙二酸盐试验等)的代谢能力以及多种酶类(尿素酶试验、淀粉酶试验等)的存在与否等特性。上述反应常导致反应体系的pH值变化或产生显色物质，放入合适的酸碱指示剂或显示剂可显示结果的阳性或阴性。

常规各项生化反应结果(阴性或阳性)的判定是根据比色法的原理　。将菌种接种到鉴定板后进行培养，由于细菌各自的酶系统不同，新陈代谢的产物也有所不同，而这些产物又具有不同的生化特性，因此各生化反应的颜色变化各不相同。仪器每隔1 h自动测定每一生化反应孔的透光度，当生长对照孔的透光度达到终点阈值时，指示已完成反应。部分仪器在生化反应的底物上标记荧光物质，生化反应如为阳性，则可激发荧光，通过检测荧光强度的变化，可以更快速地得到生化反应的结果。肠杆菌科等生长快速的细菌常在4～6 h内得出鉴定结果，其他临床常见细菌也常在6～10 h内得出鉴定结果。

数据库中的生化反应被分为多组，一般3个生化反应为1组，每种生化反应只有“阳性”或“阴性”结果，计算机识别为“1”或“0”二进制数字。每组第1、2和3位的生化反应如为阳性，则分别计为4、2、1，若为阴性则记为0。将3个反应的值相加，得到O～7之间的1个数值。如选用30个生化反应，共10组，得到10位数的生物数码;有时还需增加补充试验即获得11位生物数码。系统将最后一次判读的结果所得到的生物数码，与菌种数据库中标准生物模型比较，得出鉴定结果及可能性(ID%)。

每种细菌对不同生化反应为阳性结果的几率可能不同，某种细菌可能出现的各种编码的相应几率之和等于l。如果一个编码只对应一种细菌，无论几率大小，该种细菌的可能性(ID%)均为99%。如果一个编码对应两种或两种以上种类的细菌，应计算每种细菌出现的几率所占的百分比ID%。如ID%≥99%，为该种菌的可能性非常大;如ID%≥90%，为该种菌的可能性较大;如ID%≥80%，该种菌的可能性也较大，但需做补充试验进一步确证;如ID%＜80%，则一般无法准确区分菌种，必须增加多个补充试验才可得出准确结果。