质变型异常（B类），与剂量和药理作用无关系，难预测，发生率低，致死率高。包括遗传药理学不良反应、药物变态反应。
（一）遗传药理学不良反应
很多药物在肝中代谢，多数情况下，药物代谢物的作用较原药为低，毒副反应也相应减弱（解毒功能）。不同的药物有不同的代谢途径，有的药物氧化，有的还原，有的水解，这些代谢反应都是在相应的酶作用下进行的。如果某种酶不足，则相应的代谢过程就会受阻，而导致原形药物在体内蓄积、效应也相应增强。许多因素（疾病、年龄、性别、机体状况等）都可影响体内的酶量及其功能。但是，B类反应专指由于基因遗传原因而造成的药物不良代谢。
如人群中的每一个体对异烟肼代谢能力是不同的，主要分为慢乙酰化者和快乙酰化者。当服用相同剂量的异烟肼时，慢乙酰化者的血药浓度远比快乙酰化者为高，易出现原形药物在体内的蓄积而导致周围神经炎。快乙酰化者会产生较多具有肝毒性的代谢物乙酰肼，产生肝损害。
（二）药物变态反应
这是外来的抗原性物质与体内抗体间所发生的一种非正常的免疫反应。通常，外来的抗原进入机体，使淋巴细胞或体液免疫系统致敏，使机体处于致敏状态中。而当机体再次接触同样的变态反应原时，抗原与抗体产生反应，引起某种程度的组织损伤或功能障碍。药物变态反应可波及全身各器官、组织，可分为全身性反应和皮肤反应两大类。
1．全身性反应
（1）血液病样反应：主要有颗粒性白细胞减少或缺乏症、血小板减少症、再生障碍性贫血，巨型幼红细胞性贫血等。
（2）血清病样反应：表现有发热、关节肿痛、全身淋巴结肿大、腹痛、嗜酸性粒细胞增多、血沉加快、短暂性蛋白尿，并常伴有荨麻疹，严重者可因血管神经性水肿，喉头水肿或脑水肿而死亡。
（3）心血管系统反应：心肌损伤、心脏损伤、小血管炎，间质性心肌或心包炎，表现为各种形式的心电图异常，且常伴有其他系统的过敏症状。
（4）肝炎样反应：黄疸、肝功能障碍、肝酶升高，重症可出现急性重型肝炎，并伴有发热、皮疹等症状。
（5）红斑狼疮样反应：诱发或加重结缔组织病，使播散性狼疮复发或加剧，或者狼疮细胞检查阳性而无症状。属于本类反应的尚有肺纤维化、皮肤硬化等。
（6）神经系统变化：惊厥、脑炎、小脑损害、锥体外系损害及其他部位的神经损害。
（7）呼吸道反应：喉头水肿，支气管痉挛而致哮喘、过敏性鼻炎等。
（9）过敏性休克：
2．皮肤反应 皮肤反应表现为各式各样的皮肤病变，轻者瘙痒、粟粒样疹、荨麻疹、固定性药疹、紫癜型药疹、湿疹皮炎样药疹，重者表现为表皮脱落（剥脱性皮炎、大疱表皮松解萎缩型药疹以及重症多形红斑等）。某些药物则可致光敏性药疹。上述的症状，单独出现一种的机会较少，常常是同时存在多种症状。最常见的症状有皮疹、瘙痒、喷嚏、哮喘、淋巴结肿大、发热等，且往往伴随其他症状同存。
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