一般亲属关系鉴定与检验

五、一般亲属关系鉴定与检验

随着全基因组扫描的广泛应用，基于全基因组标记信息进行亲属关系的检验成为一个新的研究课题，这些方法的发展为后基因组时代下亲属关系鉴定提供了新的思路。

OLSON提出利用马尔柯夫过程模型（Markov-process model）识别兄弟对分析中的非兄弟对（半同胞对、无关个体对等），并检测这些非兄弟对间的真实亲属关系。该方法仍是基于计算他们之间共享同源等位的原理，但因它采用的是全基因组（或至少半个基因组以上）的标记信息，所以该方法具有较高的检测准确性。

该方法的基本思路为：

（1）计算遗传标记平均信息含量（average marker information content，AMIC）和T利用已有数据，通过计算基因组中每1 cM间隔的标记信息含量，对其求平均后算出遗传标记平均信息含量（AMIC）；计算已分型基因组的总长度（cM）除以150后所得的值，定义为T。

（2）计算最优分类界值（optimal classification value，OCVs）根据不同的遗传标记图谱（marker map）的信息量、分型基因组的数目、标记集和群体，通过计算机模拟，拟合出区分不同亲属关系对的OCVs关于AMIC和T的对数曲线回归方程，并根据（1）中的AMIC和T值算出区分全同胞－半同胞、无关个体－同卵双生子和亲－子等关系的OCVs。

（3）计算每1个对子的多基因座共享同源等位基因概率根据一些计算多基因座共享IBD概率的标准算法，计算多基因座共享同源等位基因概率，并计算每1个对子内共享不同IBD基因数目概率的差异部分的预测值。其中，对于无关个体对、半同胞对、全同胞对和同卵双生子对，计算共享0个IBD基因与2个IBD基因的概率差Y_j，j表示对子，对于亲子对则计算共享1个IBD基因与0及2个IBD基因的概率差Y_j和的计算方法略有不同。

（4）通过比较Y_j与OCVs的值对每1个对子进行亲属对归类可分为无关个体对、半同胞对、全同胞对、同卵双生子对；根据可对根据Y_j分类的全同胞对重分类为全同胞对和亲子对。

Olson提出的这个方法已经整合到统计遗传学分析软件S．A．G．E中，有兴趣的读者可以自行学习。其实，根据共享IBD的原理，该方法还能确定叔侄关系和祖父母－孙子关系，因其与半同胞共享IBD值的概率分布相同（参考表23－4）。