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消减杂交技术和抑制性消减杂交技术

时间:2022-03-23 理论教育 版权反馈
【摘要】:消减杂交技术最早用于寻找由于缺失而导致遗传性疾病的相关基因。该技术的主要缺点在于无法对低度表达的基因进行克隆,一些改良后的消减杂交技术如代表性差异分析法、酶降解消减技术等依然存在上述问题。抑制性消减杂交技术则是一种简便有效,以抑制PCR和消减杂交为基础的分离差异表达基因的新技术。抑制性杂交技术克服了消减杂交技术无法克隆低度表达基因的缺陷,并且降低了假阳性率,相对于其他差异显示技术具有很大的优越性。

消减杂交技术(subtractive hybridization,SH)最早用于寻找由于缺失而导致遗传性疾病的相关基因。其后Liang等将其应用于2个不同的cDNA文库,将两者变性后复性再进行杂交;然后,采用亲和素-生物素结合或羟基磷灰石层析技术分离未杂交的部分,由此获得呈差异表达的基因片段。该技术的主要缺点在于无法对低度表达的基因进行克隆,一些改良后的消减杂交技术如代表性差异分析法(RDA)、酶降解消减技术(EDS)等依然存在上述问题。

抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)则是一种简便有效,以抑制PCR和消减杂交为基础的分离差异表达基因的新技术。该技术的操作流程包括两轮杂交和两轮PCR扩增,可以有效扩增目的cDNA片段。抑制性杂交技术克服了消减杂交技术无法克隆低度表达基因的缺陷,并且降低了假阳性率,相对于其他差异显示技术具有很大的优越性。

差异显示技术分析正常肝细胞、普通肝癌细胞和具有某一特性(如侵犯肝门静脉、易转移、耐药等)肝癌细胞的表达基因的差异,可以比较系统而完整地揭示肝癌发生、发展过程中相关基因存在状态和功能状况。Hsu等通过比较肝癌与非肝癌组织,克隆出了与MXR7(从抗二羟蒽酮的人胃癌细胞中分离的特异基因片段)序列相同的一段cDNA,将其制成探针检测肝癌组织中MXR7mRNA时发现:在<3cm的肝癌中,MXR7mRNA的表达(77%)显著高于AFPmRNA的表达(41%)及血清AFP的升高(43%),为进一步研究其生物学特性提供根据;并对113例单灶原发性肝癌患者进行了4年随访研究,结果发现:MXR7mRNA的表达与血清AFP升高、AFPmRNA、CD24mRNA的表达水平以及肝癌浸润、分级分期密切相关,提示MXR7mRNA可望用作肝癌早期诊断的敏感指标。

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