光武7年（1903）12月23日（阴历11.4），皇帝声称明年是宪宗继妃——明宪太后洪氏（南阳洪氏洪在龙之女）结婚的60周年，所以指示大臣们举行庆祝仪式。不过，太后自这年12月末起健康开始恶化，到了第二年，即光武8年（1904）1月2日（阴历1903.11.15），太后在庆运宫寿仁堂离开了人世。《高宗实录》中将她的死亡称为“崩”。因为现在是帝国，所以“升遐”被改为“崩”。这天，皇帝曾下令在圜丘坛、宗庙及名山举行了祈祷祭祀，但没有产生效果，太后享年73岁。太后作为宪宗的继妃被迎娶进宫，但没有后嗣，所以度过了寂静孤独的一生。太后的殡殿被定在兴德殿，魂殿被定在仁昭殿。
在太后的国丧期间，发生了一件重大的政治事件。2月9日，日本舰队向停泊在仁川前海中的俄国舰队发起进攻，从而引发了俄日战争。2月23日（阴历1.8），外部大臣署理李址镕与日本特命全权公使林权助签订了《韩日议定书》，据此，日本可以干涉大韩帝国的国内政治，大韩帝国要给日军提供军事用地。
在韩半岛成为战场的同时，3月14日（阴历1.28），太后开始出殡。第二天，太后被埋葬在宪宗景陵的左山冈，该葬礼实行的是三个月安葬之礼法。该陵现位于东九陵内。太后的谥号被定为“孝定”，徽号被定为“慈温”，殿号被定为“孝惠”，陵号被定为“正陵”。
葬礼结束之后，三个都监均编纂了仪轨。首先，国葬都监编纂了由4册、452章构成的《〈明宪太后〉国葬都监仪轨》。该仪轨共制作了7件，7件目前全部尚存。[1]仪轨中收录了长达76页的彩色“发靷班次图”，也收录了国葬上所使用的丧舆等的彩色图说。通过与明成皇后的国葬相比可知，太后的国葬规模有所缩小。
其次，殡殿魂殿都监编纂了由5册、452章构成的《〈明宪太后〉殡殿•魂殿都监仪轨》。该仪轨共制作了7件，7件目前全部尚存。[2]仪轨中收录了殡殿与魂殿上所使用的各种器物的彩色图说。
最后，山陵都监编纂了由2册、327章构成的《〈明宪太后〉景陵山陵都监仪轨》。该仪轨共制作了7件，7件目前全部尚存。[3]仪轨中收录了建于山陵附近的丁字阁等各种设施的彩色图说。
太后的大丧（三年之丧）结束后，按照惯例，要将孝惠殿上供奉的太后神主供奉到宗庙（太庙）里。为此，光武9年（1905）12月11日（阴历11.15），高宗设置了祔庙都监，任命特进官李根命为都提调，开始准备祔庙仪式。第二年，即光武10年（1906）2月18日（阴历1.25），太后神主被供奉到了宗庙里。
早在光武9年（1905）11月17日（阴历10.21）时，由于缔结了恥辱的《韩日协商条约（乙巳条约）》，导致国内一片骚乱。议政府、宫内府的大臣们与朝野众官吏连日上疏要求处罚“乙巳五贼”及宣布条约无效。李根命也几次上疏请求处罚缔结《乙巳条约》的大臣们，李根命正是在此期间被委任以都提调一职的。身兼侍从武官长与陆军副将的闵泳焕于11月30日（阴历11.4）自杀。自此，宫内府特进官赵秉世（12.1）、前任议政府赞政洪万植（12.14）、经筵官宋秉璇（1906.2.2）等也接连自杀。不过，这些抵抗并没有产生任何效应，1906年2月1日（阴历1.8），最终还是设置了统监府。
就在国家如此动荡、沉闷之中，举行了太后的祔庙仪式，也举行了简单的庆贺仪式。不过，为其间受累的众官员所赐予的奖赏却是提升官衔。祔庙仪式结束后，祔庙都监于这年的4月编纂了《〈明宪太后〉祔庙都监仪轨》。该仪轨由1册、175章（或174章）构成，共制作了9件，9件目前全部尚存。韩国精神文化研究院，上揭书，525-528页）。" class="calibre10">[4]仪轨中主要收录了护送神主向宗庙行进的43页彩色的“祔庙班次图”。此外，仪轨中也收录了祔庙时所使用的册宝等各种器物的彩色图说。
注释
[1]奎章阁藏有奎章阁本、侍讲院本、秘书监本、礼式院本、江华府本及议政府本。日本宫内厅藏有五台山本。藏书阁藏有“代行太后发靷班次图”（3-547），它是孝定太后的卷轴式发靷“班次图”。该“班次图”为出殡前由画员绘制献上，仪轨中的“班次图”就是根据该图绘制而成的。
[2]奎章阁藏有奎章阁本、侍讲院本、秘书监本、礼式院本、江华府本及议政府本。侍讲院本被制成了3册。日本宫内厅藏有五台山本。
[3]奎章阁藏有奎章阁本、侍讲院本、掌礼院本、秘书监本、江华府本及议政府本。日本宫内厅藏有五台山本。
[4]奎章阁藏有6件仪轨，分别为奎章阁本、侍讲院本、礼式院本、秘书监本、江华府本及太白山本。藏书阁藏有赤裳山本与宗庙署本。日本宫内厅藏有五台山本。有关藏书阁所藏仪轨，请参考李旭的简单题解（韩国精神文化研究院，上揭书，525-528页）。
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