MRI能否显示病变，与病变组织和背景组织之间的信号强度差别有关。如果病变位于脂肪内，可酌情使背景脂肪在T1WI和T2WI呈高信号或低信号，最大程度暴露病变。例如，如果病变在T1WI为低信号（腹水、腹膜后纤维化），它在非脂肪抑制的普通T1WI显示最佳；相反，如果病变为高信号（富含蛋白的腹水、亚急性出血），则在脂肪抑制T1WI显示较明显。在T2WI亦如此。如果病变呈低信号（纤维组织），在背景脂肪为高信号时（如回波链FSE、SSFSE）显示最佳；相反，如果病变为中等至高信号（肿大淋巴结、腹水），则在黑色背景的脂肪抑制序列显示较明显。
平扫T1WI可以提供以下组织信息：①病变组织的信号强度较低时，提示水含量或纤维组织成分异常增多；②病变组织的信号强度较高时，提示存在亚急性出血或高浓度的含蛋白液体（如黏液）；③正常的脂肪组织在普通T1WI呈高信号，在脂肪抑制T1WI呈低信号。这也是分辨脂肪性病变的可靠方法。常用的成像技术是扰相梯度回波（spoiled GRE，SP-GRE）脉冲序列，如同相位与反相位SP-GRE、脂肪抑制SP-GRE、钆对比剂增强SP-GRE和3D SP-GRE。在高场和超高场强MRI系统，SP-GRE提供多种对比度的T1WI，可以取代常规自旋回波（CSE）和快速自旋回波（FSE）。
T2WI提供的组织信息主要有：①病变组织的信号强度较高时，提示局部水分增多，良性与恶性病变均可；②信号强度较低时，提示存在急性出血、黏液囊肿或慢性纤维化；③信号强度很低时，提示钙化、黑色素瘤或铁沉积。常用的脉冲序列有常规SE和回波链SE序列（FSE、TSE、SSFSE、RARE）。脂肪在前者呈较高到中等偏低信号；在后者呈明显高信号，这不利于检出盆腔肿瘤复发和肝脏病变，为暴露病变通常需要脂肪抑制扫描。
通过在T1WI、T2WI以及动态增强扫描早期和晚期分析病变的形态和信号表现，通常可以对大部分病变作出适当诊断。
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