目前常用的基因座

时间：2022-04-16 理论教育版权反馈

【摘要】：为了与已建立的STR数据库匹配，目前，国内外的多色荧光标记miniSTR复合扩增体系多选用CODIS基因座为主。将这2个体系在同一试管中扩增后，用链霉亲和素磁珠对这两个复合扩增体系的PCR产物分离，分别电泳，得到基因型图谱。评估结果表明它提高了严重降解的微量DNA检材的检出成功率。其现已应用于法医实践。2006年，这6个miniSTR被EDNAP纳入标准基因座备选范围。同年，HILL在AAFS上介绍了27个新的非CODIS系统miniSTR基因座。

三、目前常用的miniSTR基因座

（一）以CODIS为基础的miniSTR基因座

为了与已建立的STR数据库匹配，目前，国内外的多色荧光标记miniSTR复合扩增体系多选用CODIS基因座为主。如2002年，BUTLER等建立的5个miniSTR复合扩增体系，每个体系包括3个STR基因座，除CODIS外，还有PentaD、PentaE基因座。此后，Bode Technology Group建立了2个体系： BodePlex 1（D13S317，D21S11，D7S820，D16S539和CSF1PO）和BodePlex 2（TPOX，FGA，D7S820和D18S51）。它们在“9．11”遇难者遗骸的个人识别中发挥了重要作用。

在我国，刘超等重新设计了2个体系的miniSTR引物，将体系1（D5S818，D8S1179和D16S539）的正向引物5’端进行荧光素标记，将体系2（vWA，D21S11和D13S317）的正向引物5’端用荧光素标记，其反向引物的5’端用生物素标记（表21－6）。将这2个体系在同一试管中扩增后，用链霉亲和素磁珠对这两个复合扩增体系的PCR产物分离，分别电泳，得到基因型图谱。该技术可以提高1次实验达到的个体分辨力，也降低了成本。

表21－6　2个miniSTR（属CODIS系统）扩增体系引物及标记

2006年AB公司推出了商品化的miniFiler试剂盒。它包括了8个CODIS位点（D13S317，D7S820，D2S1338，D21S11，D16S539，D18S51，CSFIPO，FGA）及性别位点Amelogenin，片段长度范围为74～245 bp。评估结果表明它提高了严重降解的微量DNA检材的检出成功率。其现已应用于法医实践。

（二）非CODIS系统miniSTR研究

2005年，COBLE等建立了NC01 miniplex（D10S1248，D14S1434，D22S1045）和NC02 miniplex（D4S2364，D2S441，D1S1677）2个体系，研究结果显示其分型可靠，灵敏度高。2006年，这6个miniSTR被EDNAP（European DNA Profiling Group）纳入标准基因座备选范围。同年，HILL在AAFS（American Academy of Forensic Sciences）上介绍了27个新的非CODIS系统miniSTR基因座。后来，类似的报道很多。如2007年韩国的CHUNG等报道了采用3个非CODIS复合扩增系统（体系Ⅰ为D10S1248，D14S1434，D22S1045；体系Ⅱ为D1S1677，D2S441，D4S2364；体系Ⅲ为D3S3053，D6S474，D20S482）。

2009年，我国冯冬亮、刘超等报道了非CODIS系统miniSTR的应用研究，见图21－4。