迄今的研究已经证明，辨证与辨病之间不存在一对一的同一模式，不可能简单地把辨证等同于辨病，更不可能在中西医的现有发展水平上直接把辨证与辨病合并起来。需要大力加强证与病的病理研究，从人身上如实地揭示出证与病之间的内在关系，认清其交叉点和差异点，把它们纳入一个统一的视野，分别从其交叉点及差异点入手进行研究，遵循“同则统，异则分”的发展途径，形成一个统一中包含多样性的临床诊治体系。
1. 辨证与辨病相统一的方式 所谓辨证与辨病相结合，不是把辨证与辨病一对一地相互合并，成为一种既包含着辨证与辨病；又不是原来的辨证与辨病的诊治方式，从而取消辨证与辨病。更不是把辨证归并到辨病，取消中医的辨证；或把辨病归并到辨证，取消西医的辨病。辨证与辨病相统一的方式只能是“同则统，异则分”，这是辨证与辨病相结合研究应当遵循的基本思路。
所谓“同则统”，是指在证与病之间存在重叠或交叉的地方，从交叉点入手，从人身上揭示清楚证与病相交叉的具体内容、病变机制和规律，形成统一的理论和诊治方式。所谓“异则分”，是指证与病、不交叉部分。应当推动辨证与辨病各自进一步发展，各自把病变的内容、机制和规律揭示清楚，各自相对独立的诊治方式统一于新的诊治体系中。“同则统，异则分”的总目标和总结果，是建立和发展统一于新的诊治体系，这个体系应当包括三方面基本内容：①由辨证与辨病的交叉领域通过发展和融合而来的统一的诊治方式。②由中医的辨证体系中与西医的辨病无关的部分相对独立发展而来的诊治方式。③由西医的辨病体系中与中医的辨证无关的部分相对独立发展而来的诊治方式。
辨证与辨病相结合研究的根本目标，就是要建立和发展这样一个一元化的诊治体系，但是，这个一元化的诊治体系的形成，绝不是在现有发展水平上把辨证与辨病直接合并起来，需要加强证与病的深层病理研究，阐明证的病理本质及其与病的交叉与差异，建立起关于人的疾病的宏观图景的新理解、新观点，最为迫切的是以下两点：
（1）建立更全面的疾病观：中医学和西医学现有的疾病观都不全面，中医学认识的许多疾病落在西医学的视野之外，西医学认识的许多疾病落在中医学的视野之外。要消除这种差异，必须形成一种全新的视野，能够统一地俯瞰人的疾病的全局，不但能够包容中医之证和西医的病，而且能够包容证与病之外的其他病变。
（2）建立更完备的疾病谱：这种疾病谱应当全面地反映人的各种疾病，把中医的证放在它应有的地位，把西医之病放在应有的地位，把证与病之外的病变放在应有的地位。特别是，什么是证与病相交叉，什么地方交叉，什么地方不交叉？什么证与病不交叉，什么证与病是并列或远离的，都摆得清清楚楚、在这个疾病谱中，可以看清证与病的复杂关系，以此为基础，可以清醒地从交叉点入手，对于具有交叉关系的证与病进行促成其统一的研究；也可以清楚地从差异点入手，分别就证与病进行更深入的研究，以更成熟和完备的认识融入统一的体系。
建立这样一种新的统一的诊治体系，可以为临床诊治提供全方位的思路。临床病人的疾病可以是证，也可以是病，有时既证又病，有时非证非病，医生只能根据病人的实际情况来诊治。医师掌握了全面的疾病观、完备的疾病谱、一元化的诊治体系，可以把病人的具体病变放到这个全方位的诊治体系的恰当位置来对待。是典型的证就辨证论治，是典型的病就辨病论治，既证又病按其统一的方式来论治。
2. 从证与病的交叉点入手 从证与病的交叉点入手进行研究，是最现实、最具可行性的研究方向，是能够促使辨证与辨病统一起来的主要途径，应当是辨证与辨病相结合研究的首要思路。近几十年来，辨证与辨病相结合研究的主攻方向正是从证与病的交叉点入手的，已经取得了重要进展，也积累了丰富的经验。寻找证与病的交叉点的基本方法是：
（1）以西医辨病为基础：对于按西医辨病确诊的疾病，进行中医辨证分型，然后把西医的辨病治疗方法与中医的辨证治疗方法结合起来进行治疗。根据“中医脾—线粒体相关”理论，针对线粒体病的治疗可以某一健脾方为主方，再以患者的具体情况进行加减，这对线粒体病的治疗将有着划时代的意义。
（2）以中医辨证为基础：对证的病理解剖、病理生理等内容进行西医的辨病研究，认识证所包含的西医之病的内容，把中医的辨证治疗方法与西医的辨病治疗方法结合起来进行治疗。对某些不同疾病但以线粒体病变为主的疾病，可将健脾方剂为主方进行加减，对疗效的判定皆可以线粒体结构改善为标准之一，即中医的异病同治。
（3）从病变的不同发展阶段寻找结合点：在同一个病的不同发展阶段可出现不同的证，可按中医同病异治辨证治疗；在同一个证的不同发展阶段也会出现不同的病，可按中医异病同治辨证治疗。
（4）从横向上寻找交叉点：即不同的病往往存在相同的证候，即“异病同证”，可按中医“异病同治”辨证治疗；不同的证往往也存在相同的西医之“病”的内容，即“异证同病”，可按中医“同病异治”辨证治疗。
（5）宏观辨证与微观指标的交叉：即辨证微观化研究的方法，主要寻找证与西医的微观指标之间的特异性关系，认识特定证的特定微观指标，进而认识宏观的证在细胞、分子水平的微观病变内容，为中西医结合的诊断和治疗提供微观依据。
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