鉴别的顺序应为：科→属→种。
科的确定是对未知植物鉴别的首要步骤，可以利用分科检索表来检索，确定该植物的所属科。鉴别前除详细描述该植物各部特征外，还要了解该植物的产地、分布区。这样可以根据当地资料进行综合分析，进行鉴别。
1.利用已被鉴别的馆藏标本或查阅文献鉴别 标本馆是标本的一个收藏场所，压制或干燥好的植物标本，装订在台纸上，贴上标签，在标本馆中按一定顺序排列，以便查阅或研究。植物标本可通过与标本馆里已鉴别的标本进行核对，并参考现有的文献，将未知植物的描述与已出版分类群的描述比较来鉴别。
植物分类学文献是最古老、最复杂的科学文献之一，对植物鉴别非常重要。这些文献可以帮助鉴别工作者找到一个分类学类群或一个地区的相关文献，其主要文献包括以下几种。
（1）植物志（flora）：是一定地区所有植物的汇总，植物志依据其所涵盖的范围和地区不同分为地方植物志、地区植物志、大洲植物志和世界植物志。
地方植物志：包括有限的地理区域，常是一个省、市、县、山谷或者一个小的山脉。如《辽宁植物志》、《北京植物志》、《山东省植物志》、《长白山植物药志》等。
地区植物区：包括比较大的地理范围，通常是一个国家或是植物区域。如《中国植物志》、《马来西亚植物志》、《日本植物志》、《东北草本植物志》12卷等。地理范围涵盖一个国家的植物志叫国家植物志。
大洲植物志：覆盖了整个大洲，如T.G.Tutin等（1964－1980）编著的《欧洲植物志》，G.Bentham（1863－1878）编写的《澳大利亚植物志》。
世界植物志：范围更广，目前全世界尚无一部世界植物志。有几本著作涉及世界范围，如G.Bentham和J.D.Hooker（1863－1883）编著的《植物属志》，A.Engler和K.A.Prantl（1887－1919）编著的《植物自然科志》和A.Engler（1900－1954）编纂的《植物界》（Das Pflanzenreich）。
（2）手册：所记载内容比较详尽，常具有植物鉴别检索表。植物描述多为记述特殊植物类群。如《栽培植物手册》（Manual of Cultivated Plants）、《水生植物手册》（Manual of Aquatic Plants）。
（3）专著类：是对一个植物分类群的综合分类处理，常常是一个属或者一个科，包括所记载的所有种、亚种、变种和变型，也包括文献的详细回顾及作者的研究报告。如N，T.Nirov（1967）编写的《松属》（The Genvs Pinus），李德铢编写的《雪胆属的系统与进化》等。
（4）图鉴：包括绘图及对绘图的详细分析说明，可以作为鉴别植物的有利工具。如《中国高等植物图鉴》（1－5册），刘慎谔主编的《中国北部植物图志》，沈阳药科大学编著的《东北药用植物原色图志》等。
（5）分类期刊：基于信息的不断更新，例如一个地区增加了一个类群的描述或报告、名称的变化，以及其他分类信息所发的文章。期刊具有快速传递信息的功能，而植物志、手册和专著要经过收录大量的分类信息经过多年的修改才能出版。期刊是较好掌握信息的工具之一，也可以提供最新的研究进展。国内相关期刊主要有《植物分类学报》（英文版）、《植物研究》、《武汉植物研究》等。国际上与植物分类相关的主要刊物有《Taxon》（International Association of Plant Taxonomy，Berlin）、《Kew Bulletin》（Royal Botanic Gardens，Kew）、《Plant Systematics and E-volution》（Denmark）、《Botanical Journal of Linnaean Society》（London）、《Systematic Botany》（New York）等。
（6）其他：《Kew Index》（邱园索引）是至今最重要的参考文献资料，按照字母顺序排列，包含文章出版信息可供参考的分类群。第一期为邱皇家植物园编写出版的两卷（1893－1895），包括1753－1885年发表的种子植物属和种的名称。通常每五年定期出版一期《补编》（Supplement），到1985年共出版了18期补编，19期于1991年出版，包括1986－1990年的资料，之后《Kew Index》每年出版一期。
《有花植物和蕨类植物词典》（Dictionary of Flowering Plants and Ferns），由J.C.Willis编著，1973年由Airy Shaw出版了第8版。书中包括科、属、种的数量、分布等各种信息。
2.通过专业人员鉴别 需要鉴别的未知标本可以送植物学研究部门或植物标本馆，即由擅长植物类群分类的权威机构进行鉴别，这里的专家具有丰富经验，而且这些机构的文献和资料最全，鉴别起来非常方便，鉴别结果具有权威性。
3.通过网络鉴别 可将部分照片、标本的描述、绘图放到网站上，有关文字资料可通过电子邮件，请植物分类学者帮助鉴别。
来自世界各地的植物分类图片和药用植物图片放在各种网站上，这些图片可以为植物鉴别提供帮助。其中，《Taxacom》是植物分类学研究中非常有用的电子目录，世界各地的植物分类学者纷纷订阅。将未知植物的描述放到目录上就能得到鉴别，也可以将未知植物的图片和相关信息一起放到网站上，相关专家学者可以上网观察植物，发表自己的见解，对鉴别植物也很有帮助，现在越来越多的人通过这种方式获得来自世界各地专家的帮助。
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