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乙型肝炎病毒（HBV）是嗜肝DNA病毒，HBV基因组英文缩写为HBVDNA，由3 200个碱基对组成。

上文提到，乙肝病毒是以复制的形式繁殖、传播的，在乙肝病毒的复制过程中，有两个很重要的因素：一个是模板，另一个是催化剂。没有这两个因素，乙肝病毒就不能复制。乙肝病毒的复制模板是乙肝病毒脱氧核糖核酸（HBV-DNA）。乙肝病毒复制的“催化剂”就是乙肝病毒DNA 聚合酶，没有这种聚合酶的作用，乙肝病毒的复制就会停止。

（一）乙肝病毒脱氧核糖核酸（HBV-DNA）

核酸是病毒的核心部分，乙肝病毒的复制是以核酸的DNA为模板进行复制的。

1．基因复制 乙肝病毒的基因（DNA）是由两条螺旋的DNA 链连成的一个环形结构。其中一条长链（分子生物学上称为负链）已经形成完整的环状；另一条长度较短的链（分子生物学上称为正链）呈半环状。在复制过程中，这条半环状的DNA 链就会以负链为模板，在催化剂──乙肝病毒DNA聚合酶的作用下延长，最终形成完整的环状。这时的乙肝病毒基因就形成了一个完全环状的双股DNA。我们把这种DNA称作共价闭合环状DNA（即cccDNA），可以把它看作是病毒复制的原始模板。模板形成后，病毒基因会以其中的一条cccDNA为模板，利用肝细胞基因中的酶和DNA聚合酶的“催化”，一段基因又一段基因地复制，形成负链和正链。最后再装配到一起形成新的乙肝病毒DNA颗粒。

2．共价闭合环状DNA（cccDNA） cccDNA是一个完全环状的双股螺旋结构，结构非常稳定，难以破坏。乙肝病毒的基因复制是以cccDNA为模板的，cccDNA是乙肝病毒复制中重要的中间产物，一旦它在肝细胞核内形成，就具有了高度的稳定性，可长期存在于肝细胞内，不但起着上述的“模板”作用，而且还像深深扎根在泥土里的野草一样很难完全清除，所以有人把它称为“超螺旋结构”。不论用什么抗病毒药物，不论细胞内的DNA受到多大的抑制，也不论用药的时间有多久，都很难清除这种cccDNA。只要肝细胞内有很少量的cccDNA，当停药后，核内的cccDNA又可以再次成为病毒复制的“模板”，继续复制乙肝病毒的DNA，这也是乙肝很难根治的原因。

3．血液中发现HBV-DNA是乙肝病毒存在及有无复制能力的直接标志。在乙肝活动期，HBV-DNA一般均呈现阳性，病情越重，含量越高。目前临床对HBV-DNA可以做出定性和定量的检测。HBV-DNA含量还是使用某些药物（如干扰素、核苷类抗病毒药物等）和判断疗效的依据之一，药物有效，病毒复制受到明显抑制的话，HBV-DNA含量就会明显下降，甚至转阴。

（二）脱氧核糖核酸多聚酶（DNA-P）

乙肝病毒在复制过程中离不开一种重要的酶，一种叫脱氧核糖核酸多聚酶（DNA-P）的东西。它是乙肝病毒复制的“催化剂”，没有这种聚合酶的作用，乙肝病毒的复制就会停止。因此它也是乙肝病毒存在的直接依据，它也可以反映乙肝病毒的复制水平，它的活性可以较好地反映血液中乙肝病毒的含量，DNA-P正常值< 25 CPm。

DNA-P还是评价抗乙肝病毒药物是否有效的重要指标，大多数核苷类抗病毒药物如拉米夫定、阿德福韦、恩替卡韦等作用靶点就是DNA-P，用药有效后，DNA-P活性迅速下降，乙肝病毒的复制受到抑制。