我国的环境行政主管部门对于监督检查制度的执行给予了充分的关注。许多地方环境保护行政主管部门制订了有关监督检查的具体工作制度，如新疆维吾尔自治区克拉玛依市独子山区环境保护局制订了《现场检查工作制度》，规定了监督检查的内容、程序、形式、要求等内容。黑龙江省伊春市新青区环境保护局制定了《排污单位现场检查制度》，规定了监督检查的负责人、内容、程序、要求、频次、工作流程等内容。河北省张家口市涿鹿县环境保护局制定了《现场定期巡查和突击检查制度》，对于监督检查的内容、程序和注意事项等做出了相应规定。深圳市宝安区环境保护局制定了《环境执法现场检查工作管理规定》，规定了监督检查的方式、频次以及有关污染源的检测要求等内容。
实践中，我国环境保护行政主管部门积极执行监督检查制度，收到了良好的效果。如2008年5月，河北省石家庄市赵县环境保护局及安全生产监督管理局等部门联合对石家庄合成化工有限责任公司、河北赵州利民淀粉集团企业总公司、赵县利民淀粉二厂、赵县兴柏淀粉糖业有限公司、汪洋沟水质监测站及环保局自动监控中心进行监督检查。针对检查中发现的问题，责成石家庄合成化工有限责任公司尽快落实整改要求，尽快实现达标验收；要求河北赵州利民淀粉集团企业总公司污水治理设施运转正常、达标排放；要求赵县利民淀粉二厂污水治理设施运转正常，尽快办理排污许可证；要求赵县兴柏淀粉糖业有限公司污水治理设施运转正常、达标排放，加快污水处理厂二期工程建设，尽快投入使用。[12]再如2010年12月，兰州市环境保护局组成检查组对于重点排污企业进行了突击检查。并派驻专人进行24小时监督，要求企业必须将当天的污染物排放数据及设备运转情况传入兰州市环保局信息中心。[13]这些措施对于兰州市环境质量的改善起到积极的作用。
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