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群体间的遗传结构分析

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:群体遗传学认为,Fst值可以表示群体间的遗传分化程度,一般Fst值接近0时,说明群体间没有发生遗传分化。整个生命活动主要局限于渤海之内,这可能造成了莱州湾群体与其他群体间产生了地理隔离。海州湾群体和舟山群体遗传距离较小,是因为这两个群体生活于东海水域,两个水域处于一种开放状态,舟山群体三疣梭子蟹活动范围比较广,北可达黄海南部的吕泗、大沙渔场,海州湾和舟山群体的三疣梭子蟹可能存在基因交流。

群体间的分子变异等级分析(AMOVA分析),将每个群体作为一组进行AMOVA分析,具体结果见表25,AMOVA分析结果显示群体间的分子变异不显著(Fst5.0.004 23,P . 0.05),表明在整个遗传变异中群体间的变异占0.423%,99.577%的遗传变异来自于群体内部,群体间的遗传分化系数从0.424.80 ~ 0.7.0 00(Fst , 0.05)。群体间的遗传距离,鸭绿江口群体和莱州湾群体的遗传距离最大为0.0.2 32,其次是莱州湾群体和舟山湾群体0.0.1 21,海州湾群体和舟山湾群体遗传距离最小,为0.0.0 16,莱州湾群体和海州湾群体遗传距离也较小,为0.0.1 21(表26)。

表24 ITS1基因核苷酸多态位点及各单倍型在群体中的分布

续表

注:“.”表示与第一行序列碱基相同

表25 群体间的遗传变异的分子变异等级分析(AMOVA)

表26 群体间的相对遗传距离(左下方)和Fst(右上方)

本研究分析了三疣梭子蟹4个群体的ITS1序列,结果表明舟山湾群体遗传多样性指数最高,这与高保全等(2007)利用同工酶研究的舟山湾群体遗传多样性较高的结果比较一致。莱州湾群体最低,这与樊祥国等(2009)研究的莱州湾群体遗传多样性较低的结果一致,4个群体单倍型多态性都在0.90以上,接近于姜志勇等(2007)研究的福建缢蛏(Sinonovacula constric)野生群体与养殖群体的单倍型多态性(1.0),核苷酸多样性指数和单倍型多态性均高于吴琪等(2007)研究的硬壳蛤(Mercenariamercenaria)养殖群体核苷酸多样性指数(0.0.3 0)、单倍型多态性(0.4),且大多数个体具有自己独特的单倍型,说明4个群体遗传多样性还较丰富,这与李晓萍等(2011)利用微卫星研究的结果相一致。

群体遗传学认为,Fst值可以表示群体间的遗传分化程度,一般Fst值接近0时,说明群体间没有发生遗传分化。Fst值在0.00~0.05之间表示分化较弱,0.05~0.25之间表示分化中等,在0.25以上表示遗传分化极大(宋春妮等,2011),4个群体间的遗传分化达到中等或分化极大,并且分化程度都达到了极显著水平。

分析其原因,莱州湾群体与其他群体遗传距离较大,莱州湾群体生活于封闭性强的渤海,该群体是个地方性种群,越冬后,在4月上中旬开始生殖洄游,繁殖场所为渤海湾和莱州湾近岸浅水区河口附近;12月初开始越冬洄游,越冬场所为渤海深水区,至来年3月(邓景耀等,1986)。整个生命活动主要局限于渤海之内,这可能造成了莱州湾群体与其他群体间产生了地理隔离。海州湾群体和舟山群体遗传距离较小,是因为这两个群体生活于东海水域,两个水域处于一种开放状态,舟山群体三疣梭子蟹活动范围比较广,北可达黄海南部的吕泗、大沙渔场(宋海棠等,1989),海州湾和舟山群体的三疣梭子蟹可能存在基因交流。现代杂种优势理论认为,杂种优势的大小在一定程度上取决于亲本间遗传差异的大小,即遗传距离的大小,可以说差别愈大的群体间杂交,所产生的杂种优势愈大,将亲缘关系较远的群体进行杂交,以获得养殖性能较好的优势品种(孙少华等,2000),从而增强群体对环境的适应能力,所以本结果为人工优良繁育提供了数据参考。

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