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各个基因位点的遗传多态性

时间:2022-02-09 理论教育 版权反馈
【摘要】:对中国对虾进行了8个多态性位点的PCR扩增,共得到71个等位基因。每个位点得到的等位基因数从6到16不等,产物片段大小在159~600 bp之间。各个位点PIC值从0.6.2 8.0.905 1。通过计算每个位点的等位基因数、有效等位基因数、基因型数目、最高频率等位基因的频率等的变化,来确定位点多态性变化规律。通过计算基因型的P值检验,中国对虾的5个世代的Hardy-Weinberg平衡偏离常数均发生了不同程度的偏离。

对中国对虾进行了8个多态性位点的PCR扩增,共得到71个等位基因。每个位点得到的等位基因数从6到16不等,产物片段大小在159~600 bp之间。各个位点PIC值从0.6.2 8.0.905 1。通过计算每个位点的等位基因数(na)、有效等位基因数(Ae)、基因型数目(G)、最高频率等位基因的频率(F)等的变化,来确定位点多态性变化规律。5个群体的平均杂合度分别为017188.0.568 7.0.618 8.0.643 8.0.669 37,其中除第1代群体在位点RS0859、第4代群体在位点RS0018、第5代群体在位点RS06539和第6代群体在位点EN0033以外的7个位点期望杂合度值都比观察杂合度值大。通过计算基因型的P值检验,中国对虾的5个世代的Hardy-Weinberg平衡偏离常数均发生了不同程度的偏离。FP有3个群体位点偏离极其显著;CP3有5个群体位点偏离极其显著;CP4有3个群体位点偏离极其显著;CP5有2个相同的群体位点偏离极其显著;CP6仅有1个群体位点偏离极其显著。

图13 中国对虾3 个群体RS0622 位点的扩增图谱

表26 中国对虾5个群体在8个微卫星位点的遗传多态性

续表

注:*表示差异极显著(P , 0.01)。

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