纯祖3年（1803）12月13日，纯祖处理日常政事的昌德宫便殿——宣政殿的西侧行阁于酉时（晚上6点左右）发生火灾，除了宣政殿之外，就连前面并不相连的法殿——仁政殿也都烧毁。虽不清楚这究竟是失火事件还是纵火事件，但法殿的烧毁不能不说是一场严重的变故。这件事给贞纯王后造成了很大打击，12月28日，贞纯王后下达喻旨，表示要停止垂帘听政。
火灾发生时最伤神的就是仁政殿左侧璇源殿里所供奉的历代国王的御照。御照被迅速移至宙合楼旁边的西香阁里暂时供奉，待火熄灭后，才又被供回到原处。宫中禁火原本是由兵曹负责，不过，大王大妃中止了对兵曹的处罚，而是将所有的责任都归于自身的无德无能，同时开始减少肴馔，即进行减膳。纯祖也开始减膳，并移御至昌庆宫。还向朝廷内外下教，请求进谏。换言之，认为这场灾难是由百姓们的不满所带来的。纯祖还决定中止第二年年初的道贺活动。
昌德宫的中心建筑物——仁政殿的烧毁是一个非常严重的问题，所以，众大臣提议重建。但工程到了第二年，即纯祖4年8月才开始，12月17日竣工。工程之所以如此延迟，是因为这年6月发生洪水，全国受灾。另外，纯祖于两年前举行大婚时，还发生了诽谤事件，因而审问也就不断进行。该诽谤事件是讨厌老论时派的老论辟派的政治势力针对老论时派金祖淳的登场而搞出的妨害活动。因为这事，停止垂帘听政的贞纯王后于6月23日再次声明要重新进行垂帘听政，大臣们对此加以反拨，由此引起了骚动。
由于政局混乱，导致仁政殿重建工程的拖延。待到纯祖4年（1804）8月18日，政局有所安定后，纯祖这才任命户曹判书赵镇宽为营建都监提调，正式开始重建工程。该工程于4个月后竣工。
工程结束后，营建都监将其过程整理出来，并于第二年，即纯祖5年（1805）4月，将其编纂成1册《仁政殿营建都监仪轨》。该仪轨共制作了8件，分别收藏在奎章阁、户曹、礼曹、春秋馆及地方的四大史库，现有4件尚存。[1]仪轨中收录了仁政殿的外观图及工程中所使用的辘轳等道具的黑白图说，由此我们可以了解到当时仁政殿重建后的面貌。
补充说明一下，这时重建的仁政殿过了50余年，即到了哲宗8年（1857）时再次得以重修，之后便一直维持到今日。有关这次重修过程的记录仪轨，我们在后文将重新加以说明。
注释
[1]奎章阁藏有太白山本、五台山本、礼曹本和江华府本，四件均为156章。奎章阁本、户曹本、春秋馆本与赤裳山本行踪不明。
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